Specific human leukocyte antigen class I genotypes predict prognosis in resected pancreatic adenocarcinoma: A retrospective cohort study
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Patients with resected pancreatic adenocarcinoma (PAAD) often experience short-term relapse and dismal survival, suggesting an urgent need to develop predictive and/or prognostic biomarkers for these populations. Given the potential associations of the human leukocyte antigen class I ( HLA -I) genotype with oncogenic mutational profile and immunotherapy efficacy, we aimed to assess whether differential HLA -I genotype could predict the postoperative outcomes in resected PAAD patients. MATERIALS AND METHODS: HLA -I ( A , B , and C ) genotyping and somatic variants of 608 Chinese PAAD patients were determined by targeted next-generation sequencing of matched blood cells and tumor tissues. HLA - A / B alleles were classified with the available definition of 12 supertypes. The Kaplan-Meier curves of disease-free survival (DFS) and multivariable Cox proportional-hazards regression analyses were performed to determine the survival difference in 226 selected patients with radical resection. Early-stage (I-II) patients constituted the majority (82%, 185/226) and some stage I-II individuals with high-quality tumor samples were analyzed by RNA-sequencing to examine immunophenotypes. RESULTS: Patients with HLA-A02 + B62 + B44 - had significantly shorter DFS (median, 239 vs. 410 days; hazard ratio=1.65, P =0.0189) than patients without this genotype. Notably, stage I-II patients carrying HLA-A02 + B62 + B44 - had sharply shorter DFS than those without HLA-A02 + B62 + B44 - (median, 237 vs. 427 days; hazard ratio=1.85, P =0.007). Multivariate analysis revealed that HLA-A02 + B62 + B44 - was associated with significantly inferior DFS ( P =0.014) in stage I-II patients but not in stage III patients. Mechanistically, HLA-A02 + B62 + B44 - patients were associated with a high rate of KRAS G12D and TP53 mutations, lower HLA-A expression, and less inflamed T-cell infiltration. CONCLUSION: The current results suggest that a specific combination of germline HLA-A02/B62/B44 supertype, HLA-A02 + B62 + B44 - , was a potential predictor for DFS in early-stage PAAD patients after surgery.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».