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Enregistrement W4362700396 · doi:10.1101/2023.04.06.535904

The <i>Achromobacter</i> Type 3 secretion system drives pyroptosis and immunopathology via independent activation of NLRC4 and NLRP3 inflammasomes

2023· preprint· en· W4362700396 sur OpenAlexfundno aff
Keren B. Turton, Hannah Parks, Paulina Zarodkiewicz, Mohamad A. Hamad, Rachel Dwane, Georgiana Parau, Rebecca J. Ingram, Rebecca C. Coll, Clare Bryant, Miguel A. Valvano

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInfections and bacterial resistance
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilDirectorate for Biological SciencesQueen's UniversityQueen's University BelfastCystic Fibrosis Foundation
Mots-clésPyroptosisInflammasomeAchromobacterSecretionBiologyNLRC4IntracellularCell biologyMicrobiologyInnate immune systemInflammationImmune systemCaspase 1ImmunologyBacteriaBiochemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Achromobacter species are newly recognized opportunistic, pro-inflammatory Gram-negative pathogens in immunocompromised individuals, but how they interact with the innate immune system to drive inflammation is poorly understood. We created sctV (Type 3 Secretion System baseplate) mutants in three Achromobacter clinical isolates from two species and showed that all three required the T3SS to induce cell death in human macrophages. Mutating other critical T3SS components also abolished cell death, which was restored by genetic complementation. Cell death of Achromobacter -infected macrophages was contact-dependent, enhanced by bacterial internalisation, and caused by inflammasome-dependent pyroptosis (typified by Gasdermin-D cleavage and IL-1β secretion). Macrophages deficient in the inflammasome sensors NLRC4 or NLRP3 underwent pyroptosis upon bacterial internalization but those deficient in both NLRC4 and NLRP3 did not, suggesting either sensor can mediate pyroptosis induction in a T3SS-dependent manner. Detailed analysis of the intracellular trafficking of one isolate indicated that the intracellular bacteria reside in an acidic LAMP-1/dextran-positive membrane compartment. Using an intranasal mouse infection model, we observed that Achromobacter damages lung structure and causes severe illness, contingent on a functional T3SS. Together, we demonstrate that Achromobacter species can survive phagocytosis by macrophages and promote macrophage cell death and inflammation by redundant mechanisms of pyroptosis induction.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,215
Score d'incertitude au seuil0,945

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,202
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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