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Enregistrement W4362730525 · doi:10.1002/ajmg.a.63203

Biallelic variants in <scp><i>TUBGCP6</i></scp> result in microcephaly and chorioretinopathy 1: Report of four cases and a literature review

2023· review· en· W4362730525 sur OpenAlexaff
Amanda Thomas‐Wilson, John P. Schacht, David Chitayat, Susan Blasér, Francis Jeshira Reynoso Santos, Kimberly Glaser, Alesky Caffo, Ingrid M. Wentzensen, Lindsay B. Henderson, Futao Zhang, Ying Zhu, Ellen Di Corleto, Fabrício da Silva Costa, Rebecca Vink, Ebba Alkhunaizi, Laura Russell, Michael F. Buckley, Tony Roscioli, Elaine M. Pereira, Mythily Ganapathi

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Medical Genetics Part A · 2023
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and Kidney Cyst Diseases
Établissements canadiensMcGill University Health CentreHospital for Sick ChildrenUniversity of TorontoSickKids FoundationMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMicrocephalyPediatricsMedicinePhenotypeGeneticsBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Autosomal recessive microcephaly and chorioretinopathy-1 (MCCRP1) is a rare Mendelian disorder resulting from biallelic loss of function variants in Tubulin-Gamma Complex Associated Protein 6 (TUBGCP6, MIM#610053). Clinical features of this disorder include microcephaly, cognitive impairment, dysmorphic features, and variable ophthalmological anomalies including chorioretinopathy. Microcephaly can be recognized prenatally and visual impairment becomes evident during the first year of life. The clinical presentation resembles the findings in some acquired conditions such as congenital toxoplasmosis and cytomegalovirus infections; thus, it is important to recognize and diagnose this syndrome in view of its impact on patient health management and familial reproductive plans. To date, only seven molecularly confirmed patients from five unrelated families have been reported. We report an additional four unrelated patients with TUBGCP6 variants including one prenatal diagnosis and review the clinical phenotypes and genotypes of all the known cases. This report expands the molecular and phenotypic spectrum of TUBGCP6 and includes additional prenatal findings associated with MCCRP1.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0050,004
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,331
Écart entre enseignants0,305 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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