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Enregistrement W4362731153 · doi:10.1101/2023.04.08.532961

Latent taste diversity revealed by a vertebrate-wide catalogue of T1R receptors

2023· preprint· en· W4362731153 sur OpenAlexfundno aff
Hidenori Nishihara, Yasuka Toda, Tae Kuramoto, Kota Kamohara, Azusa Goto, Kyoko Hoshino, Shinji Okada, Shigehiro Kuraku, Masataka Okabe, Yoshiro Ishimaru

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineNursing
ThématiqueBiochemical Analysis and Sensing Techniques
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsUniversity of TokyoJapan Society for the Promotion of ScienceMeiji University
Mots-clésVertebrateUmamiBiologyTaste receptorTasteGene duplicationEvolutionary biologyLineage (genetic)GenePhylogeneticsGene familyPhylogenetic treeGeneticsMost recent common ancestorReceptorGenomeBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Taste is a vital chemical sense for feeding behavior. In mammals, the umami and sweet taste receptors are composed of three members of the taste receptor type 1 (T1R/TAS1R) family: T1R1, T1R2, and T1R3. Because their functional homologs exist in teleosts, only three TAS1R genes generated by gene duplication are believed to have been inherited from the common ancestor of bony vertebrates. Here, we report five previously uncharacterized TAS1R members in vertebrates, named TAS1R4 , 5 , 6 , 7 , and TAS1Rcf , through a genome-wide survey of diverse taxa. For TAS1R2 and TAS1R3 , mammalian and teleost fish genes were found to be paralogous. Phylogenetic analysis suggests that the bony vertebrate ancestor had nine TAS1Rs due to multiple gene duplications, and some TAS1R s were lost independently in each lineage; ultimately, mammals and teleosts have retained only three TAS1R s, whereas other lineages have retained more TAS1Rs . Functional assays and expression analysis in non-teleost fishes suggest that the novel T1Rs form heterodimers in taste receptor cells and contribute to the recognition of a broad range of ligands such as essential amino acids, including branched-chain amino acids, which were not previously considered as T1R ligands. These results highlight an unexpected diversity of taste sensations in both modern and the ancestors of vertebrates. The complex evolution of the taste receptor family might have enabled vertebrates to adapt to diverse habitats on Earth.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,145
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,218
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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