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Enregistrement W4362733473 · doi:10.1161/circgen.122.003834

Current State and Future of Polygenic Risk Scores in Cardiometabolic Disease: A Scoping Review

2023· review· en· W4362733473 sur OpenAlex
Jobanjit Phulka, Mishal Ashraf, Beenu K. Bajwa, Guillaume Paré, Zachary Laksman

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueCirculation Genomic and Precision Medicine · 2023
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensThrombosis and Atherosclerosis Research InstitutePopulation Health Research Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineDiseaseFramingham Risk ScoreMEDLINEMeta-analysisCoronary artery diseaseInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A polygenic risk score (PRS) is derived from a genome-wide association study and represents an aggregate of thousands of single-nucleotide polymorphisms that provide a baseline estimate of an individual's genetic risk for a specific disease or trait at birth. However, it remains unclear how PRSs can be used in clinical practice. We provide an overview of the PRSs related to cardiometabolic disease and discuss the evidence supporting their clinical applications and limitations. The Preferred Reporting Items For Systematic Reviews and Meta-Analysis Extension for Scoping Reviews protocol was used to conduct a scoping review of the MEDLINE, EMBASE, and CENTRAL databases. Across the 4863 studies screened, 82 articles met the inclusion criteria. The most common PRS related to coronary artery disease, followed by hypertension and cerebrovascular disease. Limited ancestral diversity was observed in the study sample populations. Most studies included only individuals of European ancestry. The predictive performance of most PRSs was similar to or superior to traditional risk factors. More than half of the included studies reported an integrated risk model combining a derived PRS and clinical risk tools such as the Framingham Risk Score and Pooled Cohort Equations. The inclusion of a PRS into a clinical risk model tended to improve predictive accuracy consistently. This scoping review is the first of its kind and reports strong evidence for the clinical utility of PRSs in coronary artery disease, hypertension, cerebrovascular disease, and atrial fibrillation. However, most PRSs are generated in cohorts of European ancestry, which likely contributes to a lack of PRS transferability across different ancestral groups. Future prospective studies should focus on further establishing the clinical utility of PRSs and ensuring diversity is incorporated into genome-wide association study cohorts.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,975
Score d'incertitude au seuil0,763

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,374
Écart entre enseignants0,329 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle