Isolation and Activity Analysis of Phytoene Synthase (ClPsy1) Gene Promoter of Canary-Yellow and Golden Flesh-Color Watermelon
Notice bibliographique
Résumé
Watermelon (Citrullus lanatus) is an economically important cucurbit crop. Its pulp is rich in antioxidant carotenoids, which confer a variety of flesh colors. ClPsy1 (Phytoene Synthase) is the rate-limiting enzyme for carotenoid synthesis; however, the promoter activity of ClPsy1 is still unknown. In the present study, promoter sequences were isolated from four watermelon accessions: Cream of Saskatchewan pale yellow (COS), canary yellow flesh (PI 635597), golden flesh (PI 192938), and red flesh (LSW-177), all of which express ClPsy1 at extremely high levels. Sequence alignment and cis-element analysis disclosed six SNPs between the four lines all in COS, two of which (at the 598th and 1257th positions) caused MYC and MYB cis-element binding sequence variations, respectively. To confirm ClPsy1 gene promoter activity, full-length and deletion fragments of the promoter were constructed and connected to a β-D-glucosidase (GUS) vector and transferred into tomato fruits. GUS staining was performed to analyze the key segment of the promoter. The activity of the PI 192938 ClPsy1 full-length promoter exceeded that of COS. The deletion fragment from −1521 bp to −1043 bp exhibited strong promoter activity, and contained a MYB transcription factor-binding site mutation. We combined RNA-seq with qRT-PCR to analyze the gene expression pattern between the MYB transcription factor Cla97C10G196920 and ClPsy1 gene and found that Cla97C10G196920 (ClMYB21) showed the same expression trend with ClPsy1, which positively regulates carotenoid synthesis and metabolism.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».