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Enregistrement W4363649319 · doi:10.1021/acs.analchem.3c00445

Targeted Compound Selection with Increased Sensitivity in <sup>13</sup>C-Enriched Biological and Environmental Samples Using <sup>13</sup>C-DREAMTIME in Both High-Field and Low-Field NMR

2023· article· en· W4363649319 sur OpenAlexafffund
Katelyn Downey, Carl A. Michal, Wolfgang Bermel, Amy Jenne, Ronald Soong, Venita Decker, Falko Busse, Benjamin Goerling, Hermann Heumann, Holger Boenisch, Marcel Gundy, André J. Simpson

Notice bibliographique

RevueAnalytical Chemistry · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaThe Scarborough HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesFonds de recherche du Québec – Nature et technologiesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaGovernment of OntarioOntario Ministry of Research, Innovation and ScienceKrembil FoundationCanada Foundation for Innovation
Mots-clésChemistryCarbon-13 NMRAnalytical Chemistry (journal)ChromatographyOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Chemical characterization of complex mixtures by Nuclear Magnetic Resonance (NMR) spectroscopy is challenging due to a high degree of spectral overlap and inherently low sensitivity. Therefore, NMR experiments that reduce overlap and increase signal intensity hold immense potential for the analysis of mixtures such as biological and environmental media. Here, we introduce a 13 C version of DREAMTIME (Designed Refocused Excitation And Mixing for Targets In Vivo and Mixture Elucidation) NMR, which, when analyzing 13 C-enriched materials, allows the user to selectively detect only the compound(s) of interest and remove all other peaks in a 13 C spectrum. Selected peaks can additionally be “focused” into sharp “spikes” to increase sensitivity. 13 C-DREAMTIME is first demonstrated at high field strength (500 MHz) with simultaneous selection of eight amino acids in a 13 C-enriched cell free amino acid mixture and of six metabolites in an extract of 13 C-enriched green algae and demonstrated at low field strength (80 MHz) with a standard solution of 13 C- d -glucose and 13 C- l -phenylalanine. 13 C-DREAMTIME is then applied at high-field to analyze metabolic changes in 13 C-enriched Daphnia magna after exposure to polystyrene “microplastics,” as well as at low-field to track fermentation of 13 C- d -glucose using wine yeast. Ultimately, 13 C-DREAMTIME reduces spectral overlap as only selected compounds are recorded, resulting in the detection of analyte peaks that may otherwise not have been discernable. In combination with focusing, up to a 6-fold increase in signal intensity can be obtained for a given peak. 13 C-DREAMTIME is a promising experiment type for future reaction monitoring and for tracking metabolic processes with 13 C-enriched compounds.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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