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Enregistrement W4363677567 · doi:10.1007/s42452-023-05356-1

Probing the mechanism of action (MOA) of Solanum nigrum Linn against breast cancer using network pharmacology and molecular docking

2023· article· en· W4363677567 sur OpenAlexaff
Yingying Song, Meena Kishore Sakharkar, Jian Yang

Notice bibliographique

RevueSN Applied Sciences · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCholesterol and Lipid Metabolism
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesDivision of Undergraduate EducationNanjing UniversityNanjing University of Chinese MedicineGovernment of Jiangsu Province
Mots-clésAKT1Proto-oncogene tyrosine-protein kinase SrcSignal transductionDocking (animal)Estrogen receptor alphaPharmacologyEstrogen receptorBiologyProtein kinase BSolanum nigrumBreast cancerCancer researchCancerMedicineTraditional medicineBiochemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Solanum nigrum Linn is a medicinal herb widely used in traditional Chinese medicine to treat ailments such as fever, inflammation and cancer. Although quite a few compounds have been isolated and characterized, its anticancer mechanism remains elusive. Thus, in this study, we used network pharmacology and molecular docking strategies to identify the major active ingredients in S. nigrum and reveal its putative mechanism against human breast cancer. Six compounds, quercetin, cholesterol, 3-epi-beta-sitosterol, diosgenin, medioresinol and solanocapsine, were identified to be the major active ingredients. Target identification and analysis showed that they regulate 80 breast cancer-related targets. Furthermore, network analysis showed that the six active ingredients regulate multiple pathways including ErbB signaling pathway and estrogen signaling pathway and genes AKT1 (AKT serine/threonine kinase 1), ESR1 (estrogen receptor 1), EGFR (epidermal growth factor receptor), SRC (proto-oncogene tyrosine-protein kinase Src), AR (androgen receptor) and MMP9 (matrix metalloproteinase 9) are crucial genes involved in the regulations. Molecular docking implied that quercetin could form good binding with AKT1, EGFR, SRC and MMP9. Our current study suggests that the anticancer function of S. nigrum is likely via synergistic/additive effects of multiple active ingredients’ regulations of different signaling pathways. Further studies are warranted to establish the standard for S. nuigrum to be used as a CAM (complementary and alternative medicine) in breast cancer treatment and dissect its potential interactions with chemotherapy drugs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,328
Écart entre enseignants0,289 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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