MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4364353216 · doi:10.1080/23744235.2023.2195938

Evaluation of anti-nucleocapsid level variation to assess SARS-CoV-2 seroprevalence in a vaccinated population

2023· article· en· W4364353216 sur OpenAlex
Renée Bazin, Samuel Rochette, Josée Perreault, Marie‐Josée Fournier, Yves Grégoire, Amélie Boivin, Antoine Lewin, Marc Germain, Christian Renaud

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueInfectious Diseases · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensCentre Hospitalier Universitaire Sainte-JustineUniversité de MontréalUniversité de SherbrookeHéma-Québec
Organismes subventionnairesPublic Health Agency of Canada
Mots-clésSeroprevalenceMedicineSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)VirologyCoronavirus disease 2019 (COVID-19)2019-20 coronavirus outbreakPopulationImmunologyAntibodySerologyEnvironmental healthOutbreakInternal medicineDiseaseInfectious disease (medical specialty)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Serosurveys have been key to public health decision-making since the beginning of the SARS-CoV-2 pandemic. However, several studies have uncovered that vaccination blunts the anti-nucleocapsid (N) response to a subsequent infection, which hinders the ability of serologic assays (including commercial ones) to detect recent infections. We therefore developed a new analytical approach to increase the sensitivity of detection of infection in vaccinated individuals. METHODS: Two samples were obtained from 248 SARS-CoV-2-positive (PCR-confirmed), vaccinated donors: one before the infection (reference sample) and one after (test sample). All samples were tested using an in-house, anti-N enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) which had a sensitivity of 98.1% before the mass vaccination campaign. Instead of applying a seropositivity threshold based on a single absorbance value (i.e. conventional approach), seropositivity was determined based on the ratio between the anti-N absorbance of the test and reference samples. RESULTS: The sensitivity of the new approach to detect infection in vaccinated individuals was 95.2% using a cut-off of 1.5 for the anti-N ratio, whereas that of the conventional approach was 63.3%. CONCLUSION: The new analytical approach described herein captured a significantly greater proportion of vaccinated individuals with a known history of SARS-CoV-2 infection than the conventional approach used in most serosurveys.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,192
Score d'incertitude au seuil0,649

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,144
Tête enseignante GPT0,425
Écart entre enseignants0,281 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle