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Enregistrement W4364382103 · doi:10.21203/rs.3.rs-2686759/v1

A multi-country comparative study of two treponemal tests for the serodiagnosis of Syphilis amongst Men Who Have Sex with Men (MSM): Chemo-luminescent assay vs Treponema pallidum passive particle agglutination assay

2023· preprint· en· W4364382103 sur OpenAlexaff
Lorenzo Gios, Massimo Mirandola, Maddalena Cordioli, Antonella Zorzi, Dominika Wlazly, Mohammed O. Hassan-Ibrahim, Valeska Padovese, Anabel Darmanin, Rosanna Ŵ. Peeling, Magnus Unemo, Nigel Sherriff, Karel Blondeel, Igor Toskin, Jaime H. Vera

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSyphilis Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSyphilisTreponemaMedicineMen who have sex with menGold standard (test)GynecologyInternal medicineVirology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Introduction: International guidelines recommend routine screening for syphilis (aetiological agent: Treponema pallidum subspecies pallidum) amongst key populations and vulnerable populations using tests detecting treponemal and non-treponemal antibodies. Whilst treponemal tests have high sensitivities and specificities, they differ regarding subjective or objective interpretation, throughput and workload. Chemiluminescence immunoassays (CLIAs) are cost- and time-effective automated methods for detecting treponemal antibodies. The Treponema pallidum passive particle agglutination assay (TPPA) has been considered the “gold standard” treponemal assay, however, this includes a highly manual procedure, low throughput and subjective interpretation. The present multi-country study evaluated the ADVIA Centaur® Syphilis CLIA assay compared to the reference SERODIA-TP·PA® for the serodiagnosis of syphilis amongst men who have sex with men (MSM). Method: 1,485 MSM were enrolled in Brighton (UK), Malta, and Verona (Italy) as part of a larger WHO multi-country and multi-site ProSPeRo study. Ethical approval was obtained. Serum was tested with the ADVIA Centaur® Syphilis CLIA assay (Siemens) and SERODIA-TP·PA® (Fujirebio), in accordance with the manufacturers’ instructions, for a first round of validation. A second round of validation was carried out for discrepant results that were additionally tested with both Western Blot (Westernblot EUROIMMUN ®) and an Immunoblot (INNO-LIA, Fujirebio Diagnostics). Sensitivity, specificity, positive and negative predictive value (PPV and NPV), likelihood ratios (positive/negative), and the Diagnostic Odds Ratio (DOR)/pre-post-test probability (Fagan's nomogram) were calculated. Results: Out of 1,485 eligible samples analysed in the first phase, the SERODIA-TP·PA® (Fujirebio) identified 360 positive and 1,125 negative cases. The ADVIA Centaur® Syphilis CLIA assay (Siemens) identified 366 positives, missclassifying one TPPA-positive sample. In the second phase, the ADVIA CLIA resulted in 1 false negative and 4 false positive results. Considering the syphilis study prevalence of 24% (95% CI: 22-26.7), the sensitivity and specificity of the CLIA in the second phase was 99.7% (95% CI: 97.9-100) and 99.5% (95% CI: 98.8-99.8), respectively. The area under the ROC curve was 0.997 (95% CI: 0.994-1). The PPV and NPV was 98.9% (95% CI: 97.2-99.7) and 99.9% (95% CI: 99.5-100), respectively. Conclusions: The ADVIA Centaur® Syphilis CLIA assay showed similar performance compared to the SERODIA-TP·PA®. Considering the study is based on QUADAS principles and with a homogeneous population, results are also likely to be generalisable. The automated CLIA treponemal assay confirmed to be accurate and appropriate for routine initial syphilis screening, i.e. when the reverse testing algorithm is applied. Ethics: Prior to enrolment, the research protocol was independently peer reviewed and approved by both the WHO and the site Research Ethics Committee. Participants were enrolled after signing informed consent.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,022

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,137
Tête enseignante GPT0,434
Écart entre enseignants0,297 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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