Interactions of TonB-dependent transporter FoxA with siderophores and antibiotics that affect binding, uptake, and signal transduction
Notice bibliographique
Résumé
The outer membrane of gram-negative bacteria prevents many antibiotics from reaching intracellular targets. However, some antimicrobials can take advantage of iron import transporters to cross this barrier. We showed previously that the thiopeptide antibiotic thiocillin exploits the nocardamine xenosiderophore transporter, FoxA, of the opportunistic pathogen Pseudomonas aeruginosa for uptake. Here, we show that FoxA also transports the xenosiderophore bisucaberin and describe at 2.5 Å resolution the crystal structure of bisucaberin bound to FoxA. Bisucaberin is distinct from other siderophores because it forms a 3:2 rather than 1:1 siderophore–iron complex. Mutations in a single extracellular loop of FoxA differentially affected nocardamine, thiocillin, and bisucaberin binding, uptake, and signal transduction. These results show that in addition to modulating ligand binding, the extracellular loops of siderophore transporters are of fundamental importance for controlling ligand uptake and its regulatory consequences, which have implications for the development of siderophore–antibiotic conjugates to treat difficult infections.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».