MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4365149844 · doi:10.3389/fphar.2023.1184914

Editorial: Model-informed decision making in the preclinical stages of pharmaceutical research and development

2023· editorial· en· W4365149844 sur OpenAlexaff
Rui Li, David Z. D’Argenio, Alison Betts, Donald E. Mager, Tristan S. Maurer

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Pharmacology · 2023
Typeeditorial
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueComputational Drug Discovery Methods
Établissements canadiensUniversité de MontréalCentre Hospitalier Universitaire Sainte-Justine
Organismes subventionnairesNational Institute of Biomedical Imaging and Bioengineering
Mots-clésPharmacologyMedicineDrug developmentDrug discoveryClinical pharmacologyDrugEngineering ethicsBioinformaticsEngineeringBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Editorial on the Research Topic Model-informed decision making in the preclinical stages of pharmaceutical research and developmentAlthough late-stage clinical attrition has been long considered as the most significant issue facing the pharmaceutical industry, the probability of technical success in the clinic is largely related to decisions made years earlier in the preclinical stages of Research and Development (R&D); it is at these early stages that decisions are made regarding the molecular target, modality of intervention, drug design and clinical candidate selection.Accordingly, model-informed drug development approaches that have proven useful in the clinic (e.g., quantitative systems pharmacology (QSP) modeling, physiologically based pharmacokinetic (PBPK) modeling, pharmacokinetic-pharmacodynamic (PKPD) modeling) are increasingly leveraged to support decisions in the earlier preclinical stages of R&D.These advances, however, have not been well-represented in the literature.This topic illustrates efforts to apply modeling in target verification, lead compound optimization, clinical candidate selection, and human efficacious dose prediction, with an emphasis on how modeling and simulation is being used to advance hypothesis driven research and support decision making in preclinical research.As a collection, the papers included in this topic will allow researchers to better understand the impact and limitations that such modeling has in real-world drug research, and, in turn, facilitate insight and guidance for future research in quantitative pharmacological modeling and simulation.Presented as a high-level overview, authors from several pharmaceutical companies shared their collective experiences about how modeling and simulation approaches have been used to inform various decision points from discovery to first-in-human clinical trials (Kondic et al., 2022).Target validation is considered as one of the main areas where QSP can impact drug discovery, however adoption of this approach is slow due to the multiscale nature and complexity of typical QSP models (Chelliah and van der Graaf, 2022).Diving in

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,009
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,035
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Éditorial · Signal consensuel: Éditorial
Score de désaccord entre enseignants0,037
Score d'incertitude au seuil0,125

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0090,035
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0040,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0040,003
Bibliométrie0,0030,001
Études des sciences et des technologies0,0030,002
Communication savante0,0070,004
Science ouverte0,0030,001
Intégrité de la recherche0,0130,016
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0370,024

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,123
Tête enseignante GPT0,512
Écart entre enseignants0,389 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreÉditorial

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueFrontiers in PharmacologyMême sujetComputational Drug Discovery MethodsTravaux en français237 207