Tracing Eastern Wolf Origins From Whole-Genome Data in Context of Extensive Hybridization
Notice bibliographique
Résumé
Southeastern Canada is inhabited by an amalgam of hybridizing wolf-like canids, raising fundamental questions regarding their taxonomy, origins, and timing of hybridization events. Eastern wolves (Canis lycaon), specifically, have been the subject of significant controversy, being viewed as either a distinct taxonomic entity of conservation concern or a recent hybrid of coyotes (C. latrans) and grey wolves (C. lupus). Mitochondrial DNA analyses show some evidence of eastern wolves being North American evolved canids. In contrast, nuclear genome studies indicate eastern wolves are best described as a hybrid entity, but with unclear timing of hybridization events. To test hypotheses related to these competing findings we sequenced whole genomes of 25 individuals, representative of extant Canadian wolf-like canid types of known origin and levels of contemporary hybridization. Here we present data describing eastern wolves as a distinct taxonomic entity that evolved separately from grey wolves for the past ∼67,000 years with an admixture event with coyotes ∼37,000 years ago. We show that Great Lakes wolves originated as a product of admixture between grey wolves and eastern wolves after the last glaciation (∼8,000 years ago) while eastern coyotes originated as a product of admixture between "western" coyotes and eastern wolves during the last century. Eastern wolf nuclear genomes appear shaped by historical and contemporary gene flow with grey wolves and coyotes, yet evolutionary uniqueness remains among eastern wolves currently inhabiting a restricted range in southeastern Canada.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».