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Enregistrement W4365446937 · doi:10.14745/ccdr.v49i04a08

Extensive SARS-CoV-2 testing reveals BA.1/BA.2 asymptomatic rates and underreporting in school children

2023· article· en· W4365446937 sur OpenAlexaffvenueabout
Maria M. Martignoni, Zahra Mohammadi, J. Concepción Loredo‐Osti, Amy Hurford

Notice bibliographique

RevueCanada Communicable Disease Report · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 detection and testing
Établissements canadiensUniversity of GuelphMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAsymptomaticMedicineOutbreakCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Public healthPandemicDemographySevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)PopulationPediatricsDiseaseEnvironmental healthVirologyInternal medicineInfectious disease (medical specialty)Pathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Case underreporting during the coronavirus disease 2019 (COVID-19) pandemic has been a major challenge to the planning and evaluation of public health responses. School children were often considered a less vulnerable population and underreporting rates may have been particularly high. In January 2022, the Canadian province of Newfoundland and Labrador (NL) was experiencing an Omicron variant outbreak (BA.1/BA.2 subvariants) and public health officials recommended that all returning students complete two rapid antigen tests (RATs) to be performed three days apart. Methods: To estimate the prevalence of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), we asked parents and guardians to report the results of the RATs completed by K-12 students (approximately 59,000 students) using an online survey. Results: When comparing the survey responses with the number of cases and tests reported by the NL testing system, we found that one out of every 4.3 (95% CI, 3.1-5.3) positive households were captured by provincial case count, with 5.1% positivity estimated from the RAT results and 1.2% positivity reported by the provincial testing system. Of positive test results, 62.9% (95% CI, 44.3-83.0) were reported for elementary school students, and the remaining 37.1% (95% CI, 22.7-52.9) were reported for junior high and high school students. Asymptomatic infections were 59.8% of the positive cases. Given the low survey participation rate (3.5%), our results may suffer from sample selection biases and should be interpreted with caution. Conclusion: The underreporting ratio is consistent with ratios calculated from serology data and provides insights into infection prevalence and asymptomatic infections in school children; a currently understudied population.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,918
Score d'incertitude au seuil0,162

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,060
Tête enseignante GPT0,326
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2023
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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