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Enregistrement W4365459309 · doi:10.1093/bbb/zbad044

Identification and characterization of extracellular GH3 β-glucosidase from the pink snow mold fungus,<i>Microdochium nivale</i>

2023· article· en· W4365459309 sur OpenAlexaff
Tomoya Ota, Wataru Saburi, Linda Elizabeth Jewell, Tom Hsiang, Ryozo Imai, Haruhide Mori

Notice bibliographique

RevueBioscience Biotechnology and Biochemistry · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEnzyme Production and Characterization
Établissements canadiensUniversity of GuelphAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesHokkaido University
Mots-clésFungusBiologyBotanyExtracellularSnowFungi imperfectiMicrobiologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Glycoside hydrolase family 3 (GH3) β-glucosidase exists in many filamentous fungi. In phytopathogenic fungi, it is involved in fungal growth and pathogenicity. Microdochium nivale is a severe phytopathogenic fungus of grasses and cereals and is the causal agent of pink snow mold, but its β-glucosidase has not been identified. In this study, a GH3 β-glucosidase of M. nivale (MnBG3A) was identified and characterized. Among various p-nitrophenyl β-glycosides, MnBG3A showed activity on d-glucoside (pNP-Glc) and slight activity on d-xyloside. In the pNP-Glc hydrolysis, substrate inhibition occurred (Kis = 1.6 m m), and d-glucose caused competitive inhibition (Ki = 0.5 m m). MnBG3A acted on β-glucobioses with β1-3, -6, -4, and -2 linkages, in descending order of kcat/Km. In contrast, the regioselectivity for newly formed products was limited to β1-6 linkage. MnBG3A has similar features to those of β-glucosidases from Aspergillus spp., but higher sensitivity to inhibitory effects.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,020
Score d'incertitude au seuil0,444

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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