MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4365786564 · doi:10.1105/tpc.010231

A Diterpene as an Endogenous Signal for the Activation of Defense Responses to Infection with <i>Tobacco mosaic virus</i> and Wounding in Tobacco

2003· article· en· W4365786564 sur OpenAlexfundno aff
Shigemi Seo, Hideharu Seto, Hiroyuki Koshino, Shigeo Yoshida, Yuko Ohashi

Notice bibliographique

RevueThe Plant Cell · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Virus Research Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiologyTobacco mosaic virusRepressorGene silencingRNAGeneMolecular biologyConsensus sequenceGeneticsPeptide sequenceGene expressionVirus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The potato pathogenesis-related gene PR-10a is transcriptionally activated in response to pathogen infection or elicitor treatment. Characterization of the cis-acting elements of the PR-10a promoter revealed the presence of a silencing element between residues −52 and −27 that contributes to transcriptional regulation. In this study, we have isolated a silencing element binding factor (SEBF) from potato tuber nuclei that binds to the coding strand of the silencing element in a sequence-specific manner. The consensus binding site of SEBF, PyTGTCNC, is present in a number of PR genes and shows striking similarity to the auxin response element. Mutational analysis of the PR-10a promoter revealed an inverse correlation between the in vitro binding of SEBF and the expression of PR-10a. SEBF was purified to homogeneity from potato tubers, and sequencing of the N terminus of the protein led to the isolation of a cDNA clone. Sequence analysis revealed that SEBF is homologous with chloroplast RNA binding proteins that possess consensus sequence–type RNA binding domains characteristic of heterogenous nuclear ribonucleoproteins (hnRNPs). Overexpression of SEBF in protoplasts repressed the activity of a PR-10a reporter construct in a silencing element–dependent manner, confirming the role of SEBF as a transcriptional repressor.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,073
Score d'incertitude au seuil0,324

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,058
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations66
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe Plant CellMême sujetPlant Virus Research StudiesTravaux en français237 207