MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4365812872 · doi:10.1016/j.jctube.2023.100372

Clinical features of human tuberculosis due to Mycobacterium orygis in Southern India

2023· article· en· W4365812872 sur OpenAlexfundno aff
Lydia Jennifer Sumanth, Christina Rachel Suresh, Manigandan Venkatesan, Abi Manesh, Marcel A. Behr, Vivek Kapur, Joy Sarojini Michael

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Tuberculosis and Other Mycobacterial Diseases · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTuberculosis Research and Epidemiology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchChristian Medical College, VelloreBill and Melinda Gates Foundation
Mots-clésMedicineTuberculosisMycobacterium tuberculosis complexMycobacterium tuberculosisDiseaseConcomitantVeterinary medicineInternal medicinePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mycobacterium orygis is a member of the Mycobacterium tuberculosis complex (MTBC) and causes tuberculosis in a variety of animals, including humans in South Asia. Here, we describe the clinical features associated with 8 human cases of whole genome sequence (WGS) confirmed M. orygis from a tertiary care hospital in South India during 2018–2019. The patient ages ranged from 9 to 51 years, with 5 females and 3 males included. All the patients had extrapulmonary disease with 2 having concomitant pulmonary involvement. Clinical improvement was documented after a full course of anti-tuberculosis therapy in 6 cases for whom follow-up was available. Taken together, the results show that M. orygis causes human tuberculosis in India, with a predominant extrapulmonary disease. Standardized molecular assays of this emerging member of the MTBC are needed to provide further information on the frequency of M. orygis infection in India and other countries where it is found in livestock and domestic wildlife.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,060
Tête enseignante GPT0,420
Écart entre enseignants0,360 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Clinical Tuberculosis and Other Mycobacterial DiseasesMême sujetTuberculosis Research and EpidemiologyTravaux en français237 207