A widespread Ponto-Caspian invader with a mistaken identity: integrative taxonomy elucidates the confusing taxonomy of<i>Trichogammarus trichiatus</i>(=<i>Echinogammarus</i>) (Crustacea: Amphipoda)
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Amphipods have diversified greatly in the Ponto-Caspian region. Although many of these species are prominent invaders their systematics remains unclear. Taking an integrative approach, we investigate the taxonomy of Trichogammarus trichiatus, a widespread invader in European inland waters. It was initially described from the north-eastern Black Sea coast as Chaetogammarus trichiatus by Martynov in 1932. A similar taxon, Chaetogammarus tenellus major, was described by Cărăușu from the western Black Sea in 1943 but later synonymized with C. trichiatus. Chaetogammarus trichiatus was itself shuffled between Chaetogammarus and the Atlanto-Mediterranean Echinogammarus, currently being assigned to Trichogammarus. Our analyses (six DNA markers, 60 measurements and scanning electron microscopic imaging) reveal that T. trichiatus and C. tenellus major are distinct species; the former is a Caucasian endemic, whereas the latter invaded Europe. Unexpectedly, T. trichiatus is an incipient species molecularly nested in Chaetogammarus ischnus, despite pronounced morphological and geographical differentiation. We also recover Chaetogammarus as polyphyletic, yet its member species are nested in the Ponto-Caspian radiation, thus distinct from Echinogammarus. Consequently, we reassign T. trichiatus to Chaetogammarus (Chaetogammarus trichiatus), synonymize Trichogammarus with Chaetogammarus and place C. tenellus major in the new genus Spirogammarus gen. nov. (Spirogammarus major comb. & stat. nov.). Chaetogammarus necessitates further systematic refinement.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».