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Enregistrement W4366088342 · doi:10.3389/fcimb.2023.1149994

Editorial: Hot trends in computer-aided drug design techniques

2023· editorial· en· W4366088342 sur OpenAlexaff
Luciana Scotti, Jagdish Suresh Patel, Malihe Hassanzadeh, Marcus Tullius Scotti

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Cellular and Infection Microbiology · 2023
Typeeditorial
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer therapeutics and mechanisms
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDrugComputer scienceData scienceMedicinePharmacology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The drug discovery process is complex and designing an effective and commercially viable drug 13 requires interdisciplinary work. For this reason, Computer Aided Drug Design (CADD) Centre works 14 with collaboration between structure biologists, biophysicists, and computational scientists to find new 15 therapeutic agents. The design and development of any medicine takes many years: it begins when 16 scientists learn about a biological target (e.g., a receptor, enzyme, protein, gene, etc.) that is involved 17 in a biological process thought to be dysfunctional in patients with a disease, followed by the 18 determination of specific target receptor, and finally by the determination of active compound from the 19 mass of compounds [1][2][3]. 20In the collection, we focused on the publication of papers that take Computer-assisted approaches such used as a 3D query to screen a drug-like database to retrieve hits with novel chemical scaffolds. The 58 obtained compounds were subjected to binding affinity prediction using the molecular docking 59 approach, and the results were subsequently validated using molecular dynamics (MD) simulations. 60Computer-aided drug design perspective is the review of Dr Rahman et al. Through a computational 62 approach, this study aims to contributed to the development of effective treatment methods by 63 examining the mechanisms relating to the binding and subsequent inhibition of SARS-CoV-2 64 ribonucleic acid (RNA)-dependent RNA polymerase (RdRp). The in silico method has also been 65 employed to determine the most effective drug among the mentioned compound and their aquatic, 66 nonaquatic, and pharmacokinetics' data were analyzed.D rug development is a lengthy and risky work that requires significant money, resources, and labor. 68Breast and lung cancer contributes to the death of millions of people throughout the world each year, 69 according to the report of the World Health Organization, and has been a public threat worldwide, 70 although the global medical sector is developed and updated day by day. However, no proper treatment 71 has been found until now. Therefore, this research has been conducted to find a new bioactive molecule 72 to treat breast and lung cancer-such as natural myricetin and its derivatives-by using the latest and 73 most authentic computer-aided drug-design approaches. Drug-likeness, ADME, and toxicity prediction 74 were fulfilled in the investigation of Dr Akash et al, Development of new bioactive molecules to 75 treat breast and lung cancer with natural myricetin and its derivatives: A computational and 76 SAR approach, and it is noted that all the derivatives were highly soluble in a water medium, whereas 77 they were totally free from AMES toxicity, hepatotoxicity, and skin sensitization, excluding only two 78 ligands. Thus, the authors proposed that the natural myricetin derivatives could be a better inhibitor for 79 treating breast and lung cancer. 80 Lianhua

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,016
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Éditorial · Signal consensuel: Éditorial
Score de désaccord entre enseignants0,024
Score d'incertitude au seuil0,082

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,016
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,002
Bibliométrie0,0030,002
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0050,004
Science ouverte0,0030,001
Intégrité de la recherche0,0090,011
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0240,020

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreÉditorial

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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