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Enregistrement W4366200996 · doi:10.1101/2023.04.10.23288267

Sex differences in the associations of genetic, sociodemographic and cardiovascular risk factors with depression in the Canadian Longitudinal Study on Aging (CLSA)

2023· preprint· en· W4366200996 sur OpenAlexafffundabout
Emilie T. Théberge, Jessica Dennis

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of British ColumbiaGovernment of Canada
Mots-clésMajor depressive disorderDepression (economics)MedicineOdds ratioLongitudinal studyDemographyComorbidityLogistic regressionBiobankDiseaseDiabetes mellitusPolygenic risk scoreRisk factorInternal medicineBioinformaticsGenotypeSingle-nucleotide polymorphismBiologyEndocrinologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Major depressive disorder (MDD) is a leading cause of morbidity and disability worldwide, with approximately twice as many women reported to have a lifetime occurrence of MDD than men. MDD is a polygenic trait, wherein hundreds to thousands of common genetic variants with small effect sizes contribute to risk of disease. This study investigated sex differences in the risk factor comorbidity and genetic architecture of MDD in over 16,000 people aged 45-85 from the Canadian Longitudinal Study on Aging (CLSA), with 21% of females (n=1,741) and 12% of males (n=1,055) coded with MDD. Polygenic risk scores (PRS) for individuals were made using sex-stratified and non-sex-specific (“both-sexes”) UK Biobank genome-wide association study summary statistics data. Odds of MDD for the sex-specific PRSs, socioeconomic, lifestyle and clinical risk factors associated with cardiovascular disease risk were assessed using a multivariable logistic regression model for each sex. Significant sex-specific risk factor associations with odds of MDD were found in females (history of ischemic heart disease (OR 1.52 (1.14-2.01), hypothyroidism (OR 1.42 (1.25-1.63), not being partnered (OR 1.34 (1.17-1.52)), having diabetes (OR 1.30 (1.11-1.52)), and higher female sex-specific autosomal PRS (OR 1.10 (1.04-1.16))) and males (high blood pressure, OR 1.35 (1.04-1.47)). Significant differences were observed in the proportion of variables that contributed to the most to each model, evaluated by relative pseudo-R 2 values. Age contributed the most to the model for both sexes (46.9% for females, 32.5% for males), wherein younger age was associated with higher odds of MDD. These results underscore the relevance for sex-disaggregating analyses of complex traits, like MDD, and the incorporation of clinical variables into models of MDD, in applications such as early detection and primary prevention.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,071
Score d'incertitude au seuil0,144

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,075
Tête enseignante GPT0,301
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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