Correlation of Electrophysiological and Fluorescence-Based Measurements of Modulator Efficacy in Nasal Epithelial Cultures Derived from People with Cystic Fibrosis
Notice bibliographique
Résumé
It has been suggested that in vitro studies of the rescue effect of CFTR modulator drugs in nasal epithelial cultures derived from people with cystic fibrosis have the potential to predict clinical responses to the same drugs. Hence, there is an interest in evaluating different methods for measuring in vitro modulator responses in patient-derived nasal cultures. Commonly, the functional response to CFTR modulator combinations in these cultures is assessed by bioelectric measurements, using the Ussing chamber. While this method is highly informative, it is time-consuming. A fluorescence-based, multi-transwell method for assaying regulated apical chloride conductance (Fl-ACC) promises to provide a complementary approach to theratyping in patient-derived nasal cultures. In the present work, we compared Ussing chamber measurements and fluorescence-based measurements of CFTR-mediated apical conductance in matching, fully differentiated nasal cultures derived from CF patients, homozygous for F508del (n = 31) or W1282X (n = 3), or heterozygous for Class III mutations G551D or G178R (n = 5). These cultures were obtained through a bioresource called the Cystic Fibrosis Canada-Sick Kids Program in Individual CF Therapy (CFIT). We found that the Fl-ACC method was effective in detecting positive responses to interventions for all genotypes. There was a correlation between patient-specific drug responses measured in cultures harbouring F508del, as measured using the Ussing chamber technique and the fluorescence-based assay (Fl-ACC). Finally, the fluorescence-based assay has the potential for greater sensitivity for detecting responses to pharmacological rescue strategies targeting W1282X.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».