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Enregistrement W4366483876 · doi:10.1016/j.gimo.2023.100810

Mosaic variants detectable in blood extend the clinicogenetic spectrum of GLI3-related hypothalamic hamartoma

2023· article· en· W4366483876 sur OpenAlex
Timothy E. Green, Mark F. Bennett, Ilka Immisch, Jeremy L. Freeman, Karl Martin Klein, John Kerrigan, Lata Vadlamudi, Erin L. Heinzen, Ingrid E. Scheffer, A. Simon Harvey, Felix Rosenow, Michael S. Hildebrand, Samuel F. Berkovic

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueGenetics in Medicine Open · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHedgehog Signaling Pathway Studies
Établissements canadiensAlberta Children's Hospital
Organismes subventionnairesNational Health and Medical Research CouncilCumming School of Medicine, University of CalgaryAustralian GovernmentMurdoch Children's Research InstituteUniversity of North Carolina at Chapel HillUniversity of MelbourneMedical Research CouncilAlberta Children's Hospital Research InstituteChildren’s Hospital of Wisconsin Research Institute
Mots-clésHypothalamic hamartomaMosaicGLI3HamartomaBiologyComputational biologyGeneticsEndocrinologyArtGeneVisual arts

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Purpose: -related disorders, clinically and genetically. Here, we searched for mosaic variants in unsolved cases. Methods: and other HH-associated genes. Mosaic variants were confirmed by droplet-digital polymerase chain reaction. Results: variants-a stop-gain (c.2639C>A; p.(Ser880Ter), VAF 3.7%) and a frameshift (c.3326_3330del; p.(Glu1109AlafsTer18), VAF 7.8%). The nonsyndromic patient with 3.7% VAF in blood had 35.8% VAF in HH tissue. He had a vestigial extra digit removed adjacent to his left fifth finger. Conclusion: mosaicism is associated with a phenotypic spectrum from PHS to HH with subtle extra PHS features, to isolated nonsyndromic HH. High-depth sequencing permits detection of low-level mosaicism, which is an important cause of both syndromic and nonsyndromic HH.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,385
Score d'incertitude au seuil0,735

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,324
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle