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Enregistrement W4366502904 · doi:10.1093/jsprm/snad005

Epigenetics and field cancerization as the caveats of carcinogenesis and recurrence of gastrointestinal malignancies: a systematic review and meta-analysis protocol

2023· review· en· W4366502904 sur OpenAlexaboutno aff
Victor Meza Kyaruzi, Emmanuel Mduma, Ahmed Abdelhammed, Tarun Kumar Suvvari, Tumusifu Manegabe jean de Dieu, Davis Banturaki, Neontle Sakaiwa, Zeinab Hammoud, Tamara Tango, Wesley Harrisson Bouche Djatche, Emmanuel Chileshe Phiri, Olobatoke Tunde, Zuraiha Waffa, Ramadhani Ngamba, Zobidah Yousif Elamin, Aymar Akilimali, Piniel Alphayo Kambey, Ramadhani H. Khamisi, Ally Mwanga, Emnet Tesfaye Shimber, Sayoki Mfinanga, Amos Mwakigonja, Christopher Dodgion

Notice bibliographique

RevueJournal of Surgical Protocols and Research Methodologies · 2023
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésField cancerizationMedicineMeta-analysisSystematic reviewInternal medicineCochrane LibraryOncologyEpigeneticsMEDLINEBioinformaticsCancerBiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Gastrointestinal malignancies constitute the most common neoplasms with increasing prevalence worldwide, which portend a dismal morbidity and higher mortality rate. Epigenetic phenotypes and field cancerization impute a cutting edge for precursor of several gastrointestinal malignancies; this genetic aberration has been implicated in tumorigenesis and recurrence of gastrointestinal malignancies. This systematic review aims at assessing the effect of epigenetics and field cancerization on carcinogenesis and recurrence of gastrointestinal malignancies. This systematic review and meta-analysis will administer the provisions of Preferred Reporting Items for Systematic Review and Meta-analysis 2020 guideline, and the review protocol has been registered at PROSPERO. The literature search will be executed through several electronic databases including EMBASE, PubMed, Scopus, Web of Science, Cochrane, Global Index Medicus, Semantic Scholar and Google Scholar. All original research articles reporting on the effect of epigenetic signatures, epigenetics and field cancerization on the carcinogenesis and recurrence of gastrointestinal cancers in adults will be included. Only articles with Newcastle–Ottawa Scale score above 4 and low risk of bias based on D1–D5 for randomized controlled trials will be included for a meta-analysis. There is no involvement of human subject participation in this review, thus giving no effect to ethical clearance approval. The evidence report of this review will be disseminated on scientific conferences and will be published to a reputable journal of gastroenterology oncology. This review has been registered at PROSPERO registry ID CRD 42023391339.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,066
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,108
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Protocole · Signal consensuel: Protocole
Score de désaccord entre enseignants0,079
Score d'incertitude au seuil0,348

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0660,108
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0060,005
Méta-épidémiologie (sens large)0,0210,022
Bibliométrie0,0110,009
Études des sciences et des technologies0,0030,004
Communication savante0,0070,006
Science ouverte0,0050,004
Intégrité de la recherche0,0070,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0790,008

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,516
Tête enseignante GPT0,570
Écart entre enseignants0,054 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreProtocole

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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