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Notice bibliographique
Résumé
AP2/ERF transcription factors (TF) are widely involved in the biological process of Ginkgo biloba , here, the ERF gene family may regulate plant stress responses through mediating secondary metabolism. To understand the regulation mechanisms of ERF gene family during this process, two transcriptome databases of ginkgo leaves under UV-B and drought stress were constructed respectively. The conserved domains, physicochemical properties and gene family homology of AP2/ERF TFs were analyzed using online bioinformatics tools, the expression of ERF gene family under these two adversity stresses were predicted and five ERF genes involved in flavonoid pathway were selected for qRT - PCR validation analysis. The results showed that 61 AP2/ERF TFs were identified from G. biloba , and which were classified into 28 GbERF, 23 GbDREB, 5 GbAP2, and 5 GbRAV, according to their conserved domains and motifs. The Amino acid numbers, isoelectric point (pI) and some other physicochemical properties varied greatly between different members. Sequence homology analysis with Arabidopsis thaliana and Glycine max showed that the members in the same AP2/ERF subfamily were closely related. In G. biloba , the GbERF and GbDREB subfamily together constitute the ERF gene family, transcriptome prediction analysis showed that the expression of most members of ERF gene family were increased under UV-B and drought stress. From the validation analysis, we concluded that the changes of the expression levels of these five genes were consistent with the prediction results. This study provided scientific basis for the function analysis of ERF gene family in G. biloba .
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».