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Enregistrement W4366783097 · doi:10.1002/advs.202207223

Liquid NanoBiosensors Enable One‐Pot Electrochemical Detection of Bacteria in Complex Matrices

2023· article· en· W4366783097 sur OpenAlexafffund
Sara M. Imani, Enas Osman, ‪Fatemeh Bakhshandeh, Shuwen Qian, Sadman Sakib, Michael MacDonald, Mark Gaskin, Igor Zhitomirsky, Deborah Yamamura, Yingfu Li, Tohid F. Didar, Leyla Soleymani

Notice bibliographique

RevueAdvanced Science · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced biosensing and bioanalysis techniques
Établissements canadiensHamilton Regional Laboratory Medicine ProgramHamilton General HospitalMcMaster University
Organismes subventionnairesOntario Ministry of Research and InnovationNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research ChairsMcMaster University
Mots-clésEscherichia coliBacillus subtilisBacteriaDeoxyribozymeDetection limitNucleic acidKlebsiella pneumoniaeChemistryDNABiosensorMicrobiologyComputational biologyBiologyNanotechnologyCombinatorial chemistryChromatographyBiochemistryMaterials science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract There is a need for point‐of‐care bacterial sensing and identification technologies that are rapid and simple to operate. Technologies that do not rely on growth cultures, nucleic acid amplification, step‐wise reagent addition, and complex sample processing are the key for meeting this need. Herein, multiple materials technologies are integrated for overcoming the obstacles in creating rapid and one‐pot bacterial sensing platforms. Liquid‐infused nanoelectrodes are developed for reducing nonspecific binding on the transducer surface; bacterium‐specific RNA‐cleaving DNAzymes are used for bacterial identification; and redox DNA barcodes embedded into DNAzymes are used for binding‐induced electrochemical signal transduction. The resultant single‐step and one‐pot assay demonstrates a limit‐of‐detection of 102 CFU mL−1, with high specificity in identifying Escherichia coli amongst other Gram positive and negative bacteria including Klebsiella pneumoniae, Staphylococcus aureus, and Bacillus subtilis. Additionally, this assay is evaluated for analyzing 31 clinically obtained urine samples, demonstrating a clinical sensitivity of 100% and specify of 100%. When challenging this assay with nine clinical blood cultures, E. coli‐positive and E. coli‐negative samples can be distinguished with a probability of p < 0.001.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,282
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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