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Enregistrement W4366815484 · doi:10.1101/2023.04.17.23288471

Creating the Pick’s disease International Consortium: Association study of <i>MAPT</i> H2 haplotype with risk of Pick’s disease

2023· preprint· en· W4366815484 sur OpenAlexafffund
Rebecca R. Valentino, William J. Scotton, Shanu F. Roemer, Tammaryn Lashley, Michael G. Heckman, Maryam Shoai, Alejandro Martínez-Carrasco, Nicole Tamvaka, Ronald L. Walton, Matthew Baker, Hannah Macpherson, Raquel Real, Alexandra I. Soto‐Beasley, Kin Y. Mok, Tamás Révész, Thomas T. Warner, Zane Jaunmuktane, Bradley F. Boeve, Elizabeth Christopher, Michael DeTure, Ranjan Duara, Neill R. Graff‐Radford, Keith A. Josephs, David S. Knopman, Shunsuke Koga, Melissa E. Murray, Kelly E. Lyons, Rajesh Pahwa, Joseph E. Parisi, Ronald C. Petersen, Jennifer L. Whitwell, Lea T. Grinberg, Bruce L. Miller, Athena Schlereth, William W. Seeley, Salvatore Spina, Murray Grossman, David J. Irwin, Edward B. Lee, EunRan Suh, John Q. Trojanowski, Vivianna M. Van Deerlin, David A. Wolk, Theresa R. Connors, Patrick M. Dooley, Matthew P. Frosch, Derek H. Oakley, Ibán Aldecoa, Mircea Balasa, Ellen Gelpí, Sergi Borrego‐Écija, Rosa Maria de Eugenio Huélamo, Jordi Gascón‐Bayarri, Raquel Sánchez‐Valle, Pilar Sanz-Cartagena, Gerard Piñol‐Ripoll, Laura Molina‐Porcel, Eileen H. Bigio, Margaret E. Flanagan, Tamar Gefen, Emily Rogalskı, Sandra Weıntraub, Javier Redding‐Ochoa, Koping Chang, Juan C. Troncoso, Stefan Prokop, Kathy L. Newell, Bernardino Ghetti, Matthew Jones, Anna Richardson, Andrew Robinson, Federico Roncaroli, Julie S. Snowden, Kieren Allinson, Oliver Green, James B. Rowe, Poonam Singh, Thomas G. Beach, Geidy E. Serrano, Xena Flowers, James E. Goldman, Allison C Heaps, Sandra Leskinen, Andrew F. Teich, Sandra E. Black, Julia Keith, Mario Masellis, István Bódi, Andrew King, Safa-Al Sarraj, Claire Troakes, Glenda M. Halliday, John R. Hodges, Jillian J. Kril, John B. Kwok, Olivier Piguet, Marla Gearing, Thomas Arzberger, Sigrun Roeber, Johannes Attems, Christopher M. Morris, Alan Thomas, Bret M. Evers, Charles L. White, Naguib Mechawar, Anne Sieben, Patrick Cras, Bart B De Vil, Peter Paul P.P. De Deyn, Charles Duyckaerts, Isabelle Le Ber, Danielle Seihean, Sabrina Turbant-Leclere, Ian R. Mackenzie, Catriona McLean, Matthew D. Cykowski, John F. Ervin, Shih‐Hsiu J. Wang, Caroline Graff, Inger Nennesmo, Rashed M. Nagra, James R. Riehl, Gábor G. Kovács, Giorgio Giaccone, Benedetta Nacmias, Manuela Neumann, Lee-Cyn Ang, Elizabeth Finger, Cornelis Blauwendraat, Mike A. Nalls, Andrew Singleton, Dan Vitale, Cristina Cunha, Agostinho Carvalho, Zbigniew K. Wszołek, Huw R. Morris, Rosa Rademakers, John Hardy, Dennis W. Dickson, Jonathan D. Rohrer, Owen A. Ross

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeurogenetic and Muscular Disorders Research
Établissements canadiensLondon Health Sciences CentreWestern UniversityOntario Brain InstituteUniversity of TorontoUniversity Health NetworkUniversity of British ColumbiaDouglas Mental Health University InstituteDouglas CollegeOccupational Cancer Research CentreHealth Sciences CentreSunnybrook Health Science Centre
Organismes subventionnairesNIHR Cambridge Biomedical Research CentreNIHR Newcastle Biomedical Research CentreMedical Research CouncilRossy FoundationSorbonne UniversitéCanada First Research Excellence FundEvelyn TrustCanadian Institutes of Health ResearchEdmond J. Safra Philanthropic FoundationUniversity of PennsylvaniaNewcastle UniversityMcGill UniversityDepartment of Health and Social CareNational Institute for Health and Care ResearchAlzheimer SocietyNIHR Oxford Biomedical Research CentreWellcome TrustAlzheimer's SocietyBrain Research UKParkinson's UKFondation Brain Canada
Mots-clésDiseaseHaplotypeAssociation (psychology)MedicinePsychologyGeneticsAlleleInternal medicineBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Pick’s disease (PiD) is a rare and predominantly sporadic form of frontotemporal dementia that is classified as a primary tauopathy. PiD is pathologically defined by argyrophilic inclusion Pick bodies and ballooned neurons in the frontal and temporal brain lobes. PiD is characterised by the presence of Pick bodies which are formed from aggregated, hyperphosphorylated, 3-repeat tau proteins, encoded by the MAPT gene. The MAPT H2 haplotype has consistently been associated with a decreased disease risk of the 4-repeat tauopathies of progressive supranuclear palsy and corticobasal degeneration, however its role in susceptibility to PiD is unclear. The primary aim of this study was to evaluate the association between MAPT H2 and risk of PiD. Methods We established the Pick’s disease International Consortium (PIC) and collected 338 (60.7% male) pathologically confirmed PiD brains from 39 sites worldwide. 1,312 neurologically healthy clinical controls were recruited from Mayo Clinic Jacksonville, FL (N=881) or Rochester, MN (N=431). For the primary analysis, subjects were directly genotyped for MAPT H1-H2 haplotype-defining variant rs8070723. In secondary analysis, we genotyped and constructed the six-variant MAPT H1 subhaplotypes (rs1467967, rs242557, rs3785883, rs2471738, rs8070723, and rs7521). Findings Our primary analysis found that the MAPT H2 haplotype was associated with increased risk of PiD (OR: 1.35, 95% CI: 1.12-1.64 P=0.002). In secondary analysis involving H1 subhaplotypes, a protective association with PiD was observed for the H1f haplotype (0.0% vs. 1.2%, P=0.049), with a similar trend noted for H1b (OR: 0.76, 95% CI: 0.58-1.00, P=0.051). The 4-repeat tauopathy risk haplotype MAPT H1c was not associated with PiD susceptibility (OR: 0.93, 95% CI: 0.70-1.25, P=0.65). Interpretation The PIC represents the first opportunity to perform relatively large-scale studies to enhance our understanding of the pathobiology of PiD. This study demonstrates that in contrast to its protective role in 4R tauopathies, the MAPT H2 haplotype is associated with an increased risk of PiD. This finding is critical in directing isoform-related therapeutics for tauopathies. Funding See funding section

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,690

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,313
Écart entre enseignants0,281 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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