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Enregistrement W4366827130 · doi:10.1101/2023.04.21.23288930

Evaluation of ATN <sub>PD</sub> framework and biofluid markers to predict cognitive decline in early Parkinson’s disease

2023· preprint· en· W4366827130 sur OpenAlexaboutno aff
Katheryn A Q Cousins, David J. Irwin, Thomas F. Tropea, Emma Rhodes, Jeffrey S. Phillips, Alice Chen‐Plotkin, Michael C. Brumm, Christopher S. Coffey, Ju‐Hee Kang, Tanya Simuni, Tatiana Foroud, Arthur W. Toga, Caroline M. Tanner, Karl Kieburtz, Brit Mollenhauer, Douglas Galasko, Samantha J. Hutten, Daniel Weintraub, Andrew Siderowf, Kenneth Marek, Gwendlyn Kollmorgen, Kathleen L. Poston, Leslie M. Shaw

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueParkinson's Disease Mechanisms and Treatments
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesAllerganGenentechH. Lundbeck A/SServierVoyager TherapeuticsAvid RadiopharmaceuticalsSanofi GenzymeF. Hoffmann-La RocheBiogenCelgeneTeva Pharmaceutical IndustriesGlaxoSmithKlineEli Lilly and CompanyBristol-Myers SquibbPfizerSanofiAlzheimer's AssociationMichael J. Fox Foundation for Parkinson's Research
Mots-clésParkinson's diseaseInternal medicineNeurodegenerationMedicineCognitive declineCerebrospinal fluidAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeCohortOncologyDiseaseLongitudinal studyGastroenterologyMontreal Cognitive AssessmentPathologyPsychologyAlzheimer's diseaseCognitive impairmentDementia

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background and Objectives In Parkinson’s disease (PD), Alzheimer’s disease (AD) co-pathology is common and clinically relevant. However, the longitudinal progression of AD cerebrospinal fluid (CSF) biomarkers – β-amyloid 1-42 (Aβ 42 ), phosphorylated tau 181 (p-tau 181 ) and total tau (t-tau) – in PD is poorly understood, and may be distinct from clinical AD. Moreover, it is unclear if CSF p-tau 181 and serum neurofilament light (NfL) have added prognostic utility in PD, when combined with CSF Aβ 42 . First, we describe longitudinal trajectories of biofluid markers in PD. Second, we modified the AD β-amyloid/tau/neurodegeneration (ATN) framework for application in PD (ATN PD ) using CSF Aβ 42 (A), p-tau 181 (T), and serum NfL (N), and tested ATN PD prediction of longitudinal cognitive decline in PD. Methods Participants were selected from the Parkinson’s Progression Markers Initiative (PPMI) cohort, clinically-diagnosed with sporadic PD or as normal Controls, and followed annually for 5 years. Linear mixed effects models (LMEM) tested the interaction of diagnosis with longitudinal trajectories of analytes (log-transformed, FDR-corrected). In PD, LMEMs tested how baseline ATN PD status (AD [A+T+N±] vs . not) predicted clinical outcomes, including Montreal Cognitive Assessment (MoCA; rank-transformed, FDR-corrected). Results Participants were 364 PD and 168 Controls, with comparable baseline mean (±SD) age (PD=62±10; Control=61±11]; Mann-Whitney-Wilcoxon: p =0.40) and gender distribution (PD=231 males [63%]; Control=107 males [64%]; chi-square: p =1.0). PD had overall lower CSF p-tau 181 (β=-0.16, 95%CI=-0.23 – -0.092, p =2.2e-05) and t-tau than Controls (β=-0.13, 95%CI=-0.19 – -0.065, p =4.0e-04), but not Aβ 42 ( p =0.061) or NfL ( p =0.32). Over time, PD had greater increases in serum NfL than Controls (β=0.035, 95%CI=0.022 – 0.048, p =9.8e-07); PD slopes did not differ from controls for CSF Aβ 42 ( p =0.18), p-tau 181 ( p =1.0) or t-tau ( p =0.96). Using ATN PD , PD classified as A+T+N± (n=32; 9%) had consistently worse cognitive decline, including on global MoCA (β=-73, 95%CI=-110 – -37, p =0.00077), than all other ATN PD statuses including A+ alone (A+T-N-; n=75; 21%). Discussion In early PD, CSF p-tau 181 and t-tau were low compared to Controls and did not increase over 5 year follow-up. Even so, classification using modified ATN PD (incorporating CSF p-tau 181 with CSF Aβ 42 and serum NfL) may identify biologically-relevant subgroups of PD to improve prediction of cognitive decline in early PD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,322
Écart entre enseignants0,278 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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