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Enregistrement W4366975805 · doi:10.1038/s41598-023-33569-2

The burden of incidental SARS-CoV-2 infections in hospitalized patients across pandemic waves in Canada

2023· article· en· W4366975805 sur OpenAlexafffundabout
Finlay A. McAlister, Jeffrey P. Hau, Clare Atzema, Andrew D. McRae, Laurie J. Morrison, Lars Grant, Ivy Cheng, Rhonda J. Rosychuk, Corinne M. Hohl, Hana Wiemer, Patrick T. Fok, Samuel Campbell, Kory Arsenault, Tara Dahn, Corinne DeMone, Kavish Chandra, Jacqueline Fraser, Patrick Archambault, Joel Turner, Éric Mercier, Gregory Clark, Sébastien Robert, Martyne Audet, Alexandra Nadeau, Audrey Nolet, Xiaoqing Xue, David Iannuzzi, Chantal Lanthier, Steven C. Brooks, Connie Taylor, Jeffrey J. Perry, Michelle Welsford, Rob Ohle, Justin Yan, Rohit Mohindra, Megan Landes, Konika Nirmalanathan, Vlad Latiu, Joanna Yeung, Natasha Clayton, Tom Chen, Jenna Nichols, Tomislav Jelić, Kate Mackenzie, Philip J. Davis, Aimee Goss, Brian H. Rowe, Katie Lin, Stephanie VandenBerg, Jake Hayward, Jaspreet Khangura, Stacey Lobos, Stacy Ruddell, Natalie Runham, Karlin Su, Frank Scheuermeyer, Daniel K. Ting, Maja Stachura, Balijeet Braar, J. Andrew Taylor, Ian B.K. Martin, Sean Wormsbecker, Lee Graham, Josie Kanu, Taylor Bootsma, Bernice Huynh, Amanda Swirhun, Tracy Taylor, Mai Hayashi, Mackenzie Cheyne, Neenah Williams, Katherine Lam, Kelsey Compagna, Vi Ho, Serena S Small, Amber Cragg, Vicky X. Xu

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCOVID-19 and healthcare impacts
Établissements canadiensAbbotsford Veterinary ClinicKelowna General HospitalEagle Ridge HospitalRoyal Inland HospitalRoyal Columbian HospitalSouth Health CampusUniversity of Alberta HospitalSaint John Regional HospitalSt. Paul's HospitalSaskatoon City HospitalUniversity of British ColumbiaHealth Sciences NorthKingston General HospitalHotel Dieu HospitalRockyview General HospitalToronto Western HospitalNorth York General HospitalJuravinski HospitalScience NorthOttawa HospitalVictoria HospitalSunnybrook HospitalHamilton General HospitalMcGill University Health CentreLions Gate HospitalUniversité LavalDalhousie UniversityHôpital Saint-François d'AssiseInstitut universitaire de cardiologie et de pneumologie de QuébecCanadian Patient Safety InstituteJewish General HospitalHôpital de l'Enfant-JésusRoyal Victoria HospitalSurrey Memorial HospitalUniversity of SaskatchewanCégep de LévisQueen's UniversityDartmouth General HospitalSunnybrook Health Science CentreAlberta Hospital EdmontonRoyal University HospitalCentre intégré de santé et de services sociaux de Chaudière-AppalachesHôpital du Sacré-Cœur de MontréalLondon Health Sciences CentreMcGill UniversityHôtel-Dieu de QuébecHealth Sciences CentreUniversity of CalgaryVancouver General HospitalRoyal Alexandra HospitalFoothills Medical CentreHôpital du Saint-SacrementUniversity of AlbertaUniversity of TorontoCentre hospitalier de l'Université LavalUniversity Health Network
Organismes subventionnairesMinistry of Colleges and UniversitiesCanadian Institutes of Health ResearchGenome British ColumbiaSaskatchewan Health Research Foundation
Mots-clésMedicinePandemicRetrospective cohort studyCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)Emergency medicineCohortEmergency departmentYoung adultCohort studyHealth carePediatricsSeverity of illnessInternal medicineIntensive care medicineDiseaseInfectious disease (medical specialty)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Many health authorities differentiate hospitalizations in patients infected with SARS-CoV-2 as being "for COVID-19" (due to direct manifestations of SARS-CoV-2 infection) versus being an "incidental" finding in someone admitted for an unrelated condition. We conducted a retrospective cohort study of all SARS-CoV-2 infected patients hospitalized via 47 Canadian emergency departments, March 2020-July 2022 to determine whether hospitalizations with "incidental" SARS-CoV-2 infection are less of a burden to patients and the healthcare system. Using a priori standardized definitions applied to hospital discharge diagnoses in 14,290 patients, we characterized COVID-19 as (i) the "Direct" cause for the hospitalization (70%), (ii) a potential "Contributing" factor for the hospitalization (4%), or (iii) an "Incidental" finding that did not influence the need for admission (26%). The proportion of incidental SARS-CoV-2 infections rose from 10% in Wave 1 to 41% during the Omicron wave. Patients with COVID-19 as the direct cause of hospitalization exhibited significantly longer LOS (mean 13.8 versus 12.1 days), were more likely to require critical care (22% versus 11%), receive COVID-19-specific therapies (55% versus 19%), and die (17% versus 9%) compared to patients with Incidental SARS-CoV-2 infections. However, patients hospitalized with incidental SARS-CoV-2 infection still exhibited substantial morbidity/mortality and hospital resource use.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,025
Score d'incertitude au seuil0,182

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,003
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,371
Écart entre enseignants0,331 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2023
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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