Neuropilin-1 Knockout and Rescue Confirms Its Role to Promote Metastasis in MDA-MB-231 Breast Cancer Cells
Notice bibliographique
Résumé
Breast cancer (BC) metastasis remains a leading cause of female mortality. Neuropilin-1 (NRP-1) is a glycoprotein receptor that plays ligand-dependent roles in BC. Clinical studies indicate its correlation with metastatic disease; however, its functional role in BC metastasis remains uncertain. CRISPR-Cas9 was used to knockout the NRP-1 gene in MDA-MB-231 BC cells, and the effects on metastasis were determined using an orthotopic mouse engraftment model. NRP-1 expression in knockout cells was rescued using a recombinant cDNA with a silent mutation in the sgRNA target-adjacent PAM sequence. Differentially expressed genes between NRP-1 knockout and control cells were determined using whole-transcriptome sequencing and validated using real-time PCR. NRP-1KO cells showed a pronounced reduction in the metastasis to the lungs. KEGG pathway analysis of the transcriptome data revealed that PI3K and ECM receptor interactions were among the top altered pathways in the NRP-1KO cells. In addition, reduction in metastasis enhancers proteins, Integrin-β3 and Tenascin-C, and genes CCL20 and FN1 and upregulation of metastasis suppressor genes, ACVRL and GPX3 in NRP-1KO were detected. These findings provide evidence for a functional role for NRP-1 in BC metastasis, supporting further exploration of NRP-1 and the identified genes as targets in treating metastatic BC.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».