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Enregistrement W4367048278 · doi:10.2196/45176

Fibroblast Activation Protein Overexpression in Gastrointestinal Tumors: Protocol for a Systematic Review and Meta-analysis

2023· review· en· W4367048278 sur OpenAlexvenueno aff
Yoshiaki Sunami, Ulrich Ronellenfitsch, Jörg Kleeff, Artur Rebelo

Notice bibliographique

RevueJMIR Research Protocols · 2023
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePeptidase Inhibition and Analysis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMeta-analysisMedicineCochrane LibraryOncologySystematic reviewInternal medicineStromal cellFibroblast activation protein, alphaMEDLINEOdds ratioBioinformaticsCancerBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: A hallmark of gastrointestinal cancer, especially pancreatic cancer, is the dense stromal tumor microenvironment in which cancer-associated fibroblasts (CAFs) represent the major stromal cell type. Preclinical studies have demonstrated that depletion of fibroblast activation protein (FAP)-positive CAFs results in increased survival. OBJECTIVE: We present the protocol for a systematic review and meta-analysis that aim to assess the currently available evidence on the effect of FAP expression on survival and clinical characteristics in gastrointestinal cancers. METHODS: The literature search and data analysis will be conducted in accordance with the PRISMA (Preferred Reporting Items for Systematic Reviews and Meta-Analyses) 2020 statement. The databases PubMed/MEDLINE, Web of Science Core Collection, Cochrane Library, and ClinicalTrials.gov will be searched via their respective online search engines. A meta-analysis comparing patients with and without FAP overexpression with the following outcomes will be performed: postoperative survival (overall and median survival; 1-, 2-, 3-, and 5-year survival rates), histological differentiation (grading), local tumor invasion, lymph node metastases, and distant metastases. Odds ratios will be calculated for binary data, and weighted mean differences and relative SD differences will be determined for continuous data. The 95% CI, heterogeneity measures, and statistical significance will be reported for each outcome. The chi-square and Kruskal-Wallis tests will be used to evaluate statistical significance. A P value of <.05 will be considered statistically significant. RESULTS: Database searches will commence in April 2023. The meta-analysis will be completed by December 2023. CONCLUSIONS: In recent years, several publications on FAP overexpression in gastrointestinal tumors have been published. The only published meta-analysis on this topic dates to 2015. It included 15 studies on various solid tumors and only 8 studies focusing exclusively on gastrointestinal tumors. The expected results of the present analysis will provide new evidence on the prognostic value of FAP in gastrointestinal tumors and thereby support health care professionals and patients in their decision-making. TRIAL REGISTRATION: PROSPERO CRD42022372194; https://tinyurl.com/352ae8b8. INTERNATIONAL REGISTERED REPORT IDENTIFIER (IRRID): PRR1-10.2196/45176.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Étiquettes directes de modèles (non validées)

Étiquettes de catégorie et de devis d'étude par modèle, issues des rondes d'étiquetage. C'est une sortie machine, non validée, et le désaccord entre modèles est livré comme donnée. Aucun devis ici n'est encore validé contre MEDLINE.

BrasCatégoriesDevis d'étudeConfiance
gemmaaucune catégorie
Domaine: non disponible · Genre: Protocole
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: non
Revue systématiquehigh
gptaucune catégorie
Domaine: non disponible · Genre: Protocole
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: non
Revue systématiquehigh
modèles en accordL'accord compare des ensembles de catégories et des devis identiques entre les bras.

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,062
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,104
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: Revue systématique
GenreSignal candidat: Protocole · Signal consensuel: Protocole
Score de désaccord entre enseignants0,062
Score d'incertitude au seuil0,330

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0620,104
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0060,004
Méta-épidémiologie (sens large)0,0200,029
Bibliométrie0,0110,010
Études des sciences et des technologies0,0030,003
Communication savante0,0050,005
Science ouverte0,0050,004
Intégrité de la recherche0,0070,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0510,005

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,529
Tête enseignante GPT0,618
Écart entre enseignants0,089 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Étiqueté directement par 2 modèles lisant le dossier complet.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeRevue systématique
Domainenon disponible
GenreProtocole

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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