MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4367051560 · doi:10.1002/path.6082

Receptor for hyaluronan‐mediated motility ( <scp>RHAMM</scp> ) defines an invasive niche associated with tumor progression and predicts poor outcomes in breast cancer patients

2023· article· en· W4367051560 sur OpenAlexafffund
Sarah E Tarullo, Yuyu He, Claire Daughters, Todd P. Knutson, Christine Henzler, Matt A. Price, Ryan Shanley, Patrice M. Witschen, Cornelia Tölg, Rachael E. Kaspar, Caroline Hallstrom, Lyubov Gittsovich, Megan L. Sulciner, Xihong Zhang, Colleen L. Forster, Carol A. Lange, Oleg Shats, Michelle Desler, Kenneth H. Cowan, Douglas Yee, Kathryn L. Schwertfeger, Eva A. Turley, James B. McCarthy, Andrew C. Nelson

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Pathology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProteoglycans and glycosaminoglycans research
Établissements canadiensLondon Health Sciences CentreWestern University
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institute of General Medical SciencesMasonic Cancer Center, University of MinnesotaNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthBreast Cancer Society of CanadaUniversity of MinnesotaElsa U. Pardee FoundationCanadian Institutes of Health ResearchAmerican Cancer SocietyCancer Research Society
Mots-clésTumor progressionTumor microenvironmentBreast cancerMetastasisCancer researchCancerMotilityBiologyPathologyImmunologyMedicineInternal medicineCell biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Breast cancer invasion and metastasis result from a complex interplay between tumor cells and the tumor microenvironment (TME). Key oncogenic changes in the TME include aberrant synthesis, processing, and signaling of hyaluronan (HA). Hyaluronan‐mediated motility receptor (RHAMM, CD168; HMMR ) is an HA receptor enabling tumor cells to sense and respond to this aberrant TME during breast cancer progression. Previous studies have associated RHAMM expression with breast tumor progression; however, cause and effect mechanisms are incompletely established. Focused gene expression analysis of an internal breast cancer patient cohort confirmed that increased RHAMM expression correlates with aggressive clinicopathological features. To probe mechanisms, we developed a novel 27‐gene RHAMM‐related signature (RRS) by intersecting differentially expressed genes in lymph node (LN)‐positive patient cases with the transcriptome of a RHAMM‐dependent model of cell transformation, which we validated in an independent cohort. We demonstrate that the RRS predicts for poor survival and is enriched for cell cycle and TME‐interaction pathways. Further analyses using CRISPR/Cas9‐generated RHAMM −/− breast cancer cells provided direct evidence that RHAMM promotes invasion in vitro and in vivo . Immunohistochemistry studies highlighted heterogeneous RHAMM protein expression, and spatial transcriptomics associated the RRS with RHAMM‐high microanatomic foci. We conclude that RHAMM upregulation leads to the formation of ‘invasive niches’, which are enriched in RRS‐related pathways that drive invasion and could be targeted to limit invasive progression and improve patient outcomes. © 2023 The Authors. The Journal of Pathology published by John Wiley &amp; Sons Ltd on behalf of The Pathological Society of Great Britain and Ireland.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,120
Score d'incertitude au seuil0,396

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe Journal of PathologyMême sujetProteoglycans and glycosaminoglycans researchTravaux en français237 207