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Enregistrement W4367180319 · doi:10.1101/2023.04.27.538511

Functional specialization of hippocampal somatostatin-expressing interneurons

2023· preprint· en· W4367180319 sur OpenAlexfundno aff
Simon Chamberland, Gariel Grant, Robert Machold, Erica R. Nebet, Guoling Tian, Monica Hanani, Klas Kullander, Richard W. Tsien

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeuroscience and Neuropharmacology Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of Mental HealthYork UniversityCharles H. Revson FoundationVetenskapsrådetNYU Langone Medical CenterNational Institute on Drug AbuseBrain and Behavior Research Foundation
Mots-clésHippocampal formationNeuroscienceHippocampusTranscriptomePopulationGABAergicBiologyIntersection (aeronautics)SomatostatinPyramidal cellGeneticsGene expressionGeneGeographyCartographyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Hippocampal somatostatin-expressing ( Sst ) GABAergic interneurons (INs) exhibit considerable anatomical and functional heterogeneity. Recent single cell transcriptome analyses have provided a comprehensive Sst -IN subtype census, a plausible molecular ground truth of neuronal identity whose links to specific functionality remain incomplete. Here, we designed an approach to identify and access subpopulations of Sst -INs based on transcriptomic features. Four mouse models based on single or combinatorial Cre- and Flp- expression differentiated functionally distinct subpopulations of CA1 hippocampal Sst- INs that largely tiled the morpho-functional parameter space of the Sst -INs superfamily. Notably, the Sst;;Tac1 intersection revealed a population of bistratified INs that preferentially synapsed onto fast-spiking interneurons (FS-INs) and were both necessary and sufficient to interrupt their firing. In contrast, the Ndnf;;Nkx2-1 intersection identified a population of oriens lacunosum-moleculare (OLM) INs that predominantly targeted CA1 pyramidal neurons, avoiding FS-INs. Overall, our results provide a framework to translate neuronal transcriptomic identity into discrete functional subtypes that capture the diverse specializations of hippocampal Sst -INs. Significance statement GABAergic interneurons are important regulators of neuronal activity. Recent transcriptome analyses have provided a comprehensive classification of interneuron subtypes, but the connections between molecular identities and specific functions are not yet fully understood. Here, we developed an approach to identify and access subpopulations of interneurons based on features predicted by transcriptomic analysis. Functional investigation in transgenic animals revealed that hippocampal somatostatin-expressing interneurons ( Sst -INs) can be divided into at least four subfamilies, each with distinct functions. Most importantly, the Sst;;Tac1 intersection targeted a population of bistratified cells that overwhelmingly targeted fast-spiking interneurons. In contrast, the Ndnf;;Nkx2-1 intersection revealed a population of oriens lacunosum-moleculare interneurons that selectively targeted CA1 pyramidal cells. Overall, this study reveals that genetically distinct subfamilies of Sst -INs form specialized circuits in the hippocampus with differing functional impact.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,076
Tête enseignante GPT0,303
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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