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Enregistrement W4367311751 · doi:10.1063/5.0134177

A roadmap for developing and engineering <i>in vitro</i> pulmonary fibrosis models

2023· article· en· W4367311751 sur OpenAlexafffund
Mohammadhossein Dabaghi, Mabel Barreiro Carpio, Neda Saraei, Jose Moran‐Mirabal, Martin Kolb, Jeremy A. Hirota

Notice bibliographique

RevueBiophysics Reviews · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInterstitial Lung Diseases and Idiopathic Pulmonary Fibrosis
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaUniversity of WaterlooMcMaster UniversitySt. Joseph’s Healthcare Hamilton
Organismes subventionnairesCanada Research Chairs
Mots-clésNintedanibIdiopathic pulmonary fibrosisPirfenidoneMedicinePulmonary fibrosisExtracellular matrixFibrosisDiseaseCancer researchPathologyLungBiologyInternal medicineCell biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Idiopathic pulmonary fibrosis (IPF) is a severe form of pulmonary fibrosis. IPF is a fatal disease with no cure and is challenging to diagnose. Unfortunately, due to the elusive etiology of IPF and a late diagnosis, there are no cures for IPF. Two FDA-approved drugs for IPF, nintedanib and pirfenidone, slow the progression of the disease, yet fail to cure or reverse it. Furthermore, most animal models have been unable to completely recapitulate the physiology of human IPF, resulting in the failure of many drug candidates in preclinical studies. In the last few decades, the development of new IPF drugs focused on changes at the cellular level, as it was believed that the cells were the main players in IPF development and progression. However, recent studies have shed light on the critical role of the extracellular matrix (ECM) in IPF development, where the ECM communicates with cells and initiates a positive feedback loop to promote fibrotic processes. Stemming from this shift in the understanding of fibrosis, there is a need to develop in vitro model systems that mimic the human lung microenvironment to better understand how biochemical and biomechanical cues drive fibrotic processes in IPF. However, current in vitro cell culture platforms, which may include substrates with different stiffness or natural hydrogels, have shortcomings in recapitulating the complexity of fibrosis. This review aims to draw a roadmap for developing advanced in vitro pulmonary fibrosis models, which can be leveraged to understand better different mechanisms involved in IPF and develop drug candidates with improved efficacy. We begin with a brief overview defining pulmonary fibrosis and highlight the importance of ECM components in the disease progression. We focus on fibroblasts and myofibroblasts in the context of ECM biology and fibrotic processes, as most conventional advanced in vitro models of pulmonary fibrosis use these cell types. We transition to discussing the parameters of the 3D microenvironment that are relevant in pulmonary fibrosis progression. Finally, the review ends by summarizing the state of the art in the field and future directions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,749
Score d'incertitude au seuil0,642

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,281
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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