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Enregistrement W4367313400 · doi:10.1101/2023.04.27.538576

p53 promotes revival stem cells in the regenerating intestine after severe radiation injury

2023· preprint· en· W4367313400 sur OpenAlexaff
Clara Morral, Arshad Ayyaz, Hsuan-Cheng Kuo, Mardi Fink, Ioannis I. Verginadis, Andrea R. Daniel, Danielle Burner, Lucy M. Driver, Sloane Satow, Stephanie Hasapis, Reem Ghinnagow, Lixia Luo, Yan Ma, Laura D. Attardi, Andy J. Minn, Jeffrey L. Wrana, Chang‐Lung Lee, David G. Kirsch

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Cells and Metastasis
Établissements canadiensUniversity of TorontoLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesSchool of Medicine, Duke UniversityNational Institutes of HealthMark Foundation For Cancer Research
Mots-clésStem cellIntestinal epitheliumBiologyEpitheliumCell biologyGastrointestinal epitheliumIonizing radiationReprogrammingCancer researchSmall intestineCellIrradiationEndocrinologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Ionizing radiation induces cell death in the gastrointestinal (GI) epithelium by activating p53. However, p53 also prevents animal lethality caused by radiation-induced GI injury. Through single-cell RNA-sequencing of the irradiated mouse intestine, we find that p53 target genes are specifically enriched in stem cells of the regenerating epithelium, including revival stem cells that promote animal survival after GI damage. Accordingly, in mice with p53 deleted specifically in the GI epithelium, ionizing radiation fails to induce revival stem cells. Using intestinal organoids, we show that transient p53 expression is required for the induction of revival stem cells that is controlled by an Mdm2-mediated negative feedback loop. These results suggest that p53 suppresses severe radiation-indued GI injury by promoting intestinal epithelial cell reprogramming. One-Sentence Summary: After severe radiation injury to the intestine, transient p53 activity induces revival stem cells to promote regeneration.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,020

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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