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Enregistrement W4367314388 · doi:10.1016/j.ebiom.2023.104584

Breath testing for SARS-CoV-2 infection

2023· article· en· W4367314388 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevueEBioMedicine · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueAdvanced Chemical Sensor Technologies
Établissements canadiensBC Cancer AgencyUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesBC Cancer FoundationVancouver Coastal Health Research Institute
Mots-clésSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)Coronavirus disease 2019 (COVID-19)2019-20 coronavirus outbreakSars virusVirologyBetacoronavirusMedicineCoronavirus InfectionsBiologyOutbreakPathologyDiseaseInfectious disease (medical specialty)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: From a public health perspective, the identification of individuals with mild respiratory symptoms due to SARS-CoV-2 infection is important to contain the spread of the disease. The objective of this study was to identify volatile organic compounds (VOCs) in exhaled breath common to infection with different variants of the SARS-CoV-2 virus to inform the development of a point-of-care breath test to detect infected individuals with mild symptoms. METHODS: A prospective, real-world, observational study was conducted on mildly symptomatic out-patients presenting to community test-sites for RT-qPCR SARS-CoV-2 testing when the Alpha, Beta, and Delta variants were driving the COVID-19 pandemic. VOCs in exhaled breath were compared between PCR-positive and negative individuals using TD-GC-ToF-MS. Candidate VOCs were tested in an independent set of samples collected during the Omicron phase of the pandemic. FINDINGS: Fifty breath samples from symptomatic RT-qPCR positive and 58 breath samples from test-negative, but symptomatic participants were compared. Of the 50 RT-qPCR-positive participants, 22 had breath sampling repeated 8-12 weeks later. PCA-X model yielded 12 distinct VOCs that discriminated SARS-CoV-2 active infection compared to recovery/convalescence period, with an area under the receiver operator characteristic curve (AUROC), of 0.862 (0.747-0.977), sensitivity, and specificity of 82% and 86%, respectively. PCA-X model from 50 RT-qPCR positive and 58 negative symptomatic participants, yielded 11 VOCs, with AUROC of 0.72 (0.604-0.803) and sensitivity of 72%, specificity 65.5%. The 11 VOCs were validated in a separate group of SARS-CoV-2 Omicron positive patients' vs healthy controls demonstrating an AUROC of 0.96 (95% CI 0.827-0.993) with sensitivity of 80% specificity of 90%. INTERPRETATION: Exhaled breath analysis is a promising non-invasive, point-of-care method to detect mild COVID-19 infection. FUNDING: Funding for this study was a competitive grant awarded from the Vancouver Coastal Research Institute as well as funding from the BC Cancer Foundation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,030
Score d'incertitude au seuil0,314

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,297
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle