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Enregistrement W4367317364 · doi:10.1016/j.jneumeth.2023.109868

Activity‐State Entropy: A novel brain entropy measure based on spatial patterns of activity

2023· article· en· W4367317364 sur OpenAlexaff
Adam Hull, J. Bruce Morton

Notice bibliographique

RevueJournal of Neuroscience Methods · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueFunctional Brain Connectivity Studies
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésResting state fMRISample entropyEntropy (arrow of time)Joint entropyConditional entropyVoxelStatistical physicsPattern recognition (psychology)Transfer entropyMathematicsDifferential entropyArtificial intelligenceComputer sciencePrinciple of maximum entropyNeurosciencePsychologyPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Brain entropy is a measure of the complexity of brain activity that has been linked to various cognitive abilities. The measure is based on Shannon Entropy, a measure from Information Theory that quantifies the information capacity of a system from the probability distribution of its states. Most fMRI studies measure brain entropy at the voxel level as time-series entropy and assume that entropic time-series indicate complex large-scale spatiotemporal patterns of activity. NEW METHOD: We developed a novel measure of brain entropy called Activity-State Entropy. The method quantifies entropy based on underlying patterns of coactivation identified using Principal Components Analysis. These patterns, termed eigenactivity states, combine in time-varying proportions. RESULTS: We showed that Activity-State Entropy is sensitive to the complexity of the spatiotemporal patterns of activity in simulated fMRI data. We then applied this measure to real resting-state fMRI data and found that the eigenactivity states that explained the most variance in the data were comprised of large clusters of coactivating voxels, including clusters within Default Mode Network regions. More entropic brains were increasingly influenced by eigenactivity states comprised of smaller and more sparsely distributed clusters. COMPARISON TO EXISTING METHODS: We compared Activity-State Entropy to Sample Entropy and Dispersion Entropy, two time-series entropy measures commonly used in neuroimaging research, and found all three measures were positively correlated. CONCLUSIONS: Activity-State Entropy provides a measure of the spatiotemporal complexity of brain activity that complements time-series based measures of brain entropy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,063
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Méta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,341
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,063
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,115
Tête enseignante GPT0,381
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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