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Enregistrement W4367320292 · doi:10.3389/fvets.2023.1178511

Cross-sectional analysis of Piroplasma species-infecting camel (Camelus dromedaries) in Egypt using a multipronged molecular diagnostic approach

2023· article· en· W4367320292 sur OpenAlexfundno aff
Olfat A. Mahdy, Ahmed Nassar, Bassma S. M. Elsawy, Heba F. Alzan, Omnia M. Kandil, Mona S. Mahmoud, Carlos E. Suárez

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Veterinary Science · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueVector-borne infectious diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInternational Development Research CentreNational Research CentreWashington State UniversityBill and Melinda Gates FoundationU.S. Department of Agriculture
Mots-clésBabesiaTheileria18S ribosomal RNABiologyVeterinary medicineAmpliconTick-borne diseasePolymerase chain reactionMultiplex polymerase chain reactionBabesiosisBabesia bovisBabesia bigeminaTickVirologyRibosomal RNAGeneParasite hostingGeneticsMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Camel piroplasmosis is a tick-borne disease (TBD) caused by hemoprotozoan parasites. Hereby, we describe a cross-sectional study aiming at identifying Piroplasma spp.-infecting camels in Egypt using a multipronged molecular diagnostic approach. A total of 531 blood samples from camels ( Camelus dromedarius ) were collected from slaughterhouses at different governorates in Egypt for analysis during the period from June 2018 to May 2019. Piroplasma spp. was identified using microscopical examination and several different and sequential polymerase chain reaction (PCR) assays targeting the 18S rRNA genes. The overall prevalence of Piroplasma spp. in microscopical and molecular analyses in the samples was 11% (58/531) and 38% (203/531), respectively. Further discriminative multiplex PCR analysis targeting the 18S rRNA gene applied on all Piroplasma spp.-positive samples allowed the detection of Theileria equi (41%) , Babesia caballi (5.4%) , Babesia bigemina (0.5%), and Babesia bovis (4%). Additionally, the blast analysis of nested (n) PCR, targeting the V4 region, amplicon sequences resulted in the identification of B. vulpes (22%), Babesia sp. (9%), and Theileria sp. (3%). Overall, the results of this study confirmed the high prevalence of TBDs caused by several types of piroplasm hemoparasites in camel and suggests the need for future interventions aimed at improving the control of these potentially debilitating diseases that may be t-hreatening important economic resources and food security in Egypt.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,178
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0030,008
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,293
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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