Microbial Energy Metabolism Fuels an Intestinal Macrophage Niche via Purinergic Signalling.
Notice bibliographique
Résumé
\# Single cell RNA-Sequencing analysis of CD11b-positive cells from lamina propria and solitary isolated lymphoid tissues of the colon. \--- The data contains unprocessed sequencing reads obtained via paired-end sequencing on the Illumina platform. Colonic cells were isolated from the lamina propria (LP) or solitary isolated lymphoid tissues (CP) from wild type (WT) or Csf2-deficient (KO) tissue and have been enriched by CD11b magnetic beads. Enriched cells were then processed and sequenced. The files display sequences containing illumina barcode reads and paired-end sequencing reads. \## Description of the data and file structure The deposited files are grouped by their identification as WT or KO and by their location within the tissue: LP or CP. The data can be used to investigate the impact of the gene Csf2 on the development and functional program of CD11b-enriched cells from distinct locations in colon of mice. \## Sharing/Access information This is a section for linking to other ways to access the data, and for linking to sources the data is derived from, if any. Links to other publicly accessible locations of the data: GSE231371 \## Code/Software The code and scripts to analyze the data set is freely available at:
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,003 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».