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Enregistrement W4367623998 · doi:10.1002/hbm.26324

Characterization of an automated method to segment the human locus coeruleus

2023· article· en· W4367623998 sur OpenAlexafffund
Ahmad Sibahi, Rushali Gandhi, Rami Al‐Haddad, Joseph Therriault, Tharick A. Pascoal, Mira Chamoun, Krysta Boutin‐Miller, Christine Tardif, Pedro Rosa‐Neto, Clifford Cassidy

Notice bibliographique

RevueHuman Brain Mapping · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAlzheimer's disease research and treatments
Établissements canadiensMontreal Neurological Institute and HospitalCentre Intégré Universitaire de Santé et de Services Sociaux du Centre-Sud-de-l'Île-de-MontréalMcGill UniversityCentre Intégré Universitaire de Santé et de Services Sociaux du Saguenay–Lac-Saint-JeanDouglas Mental Health University InstituteRoyal Ottawa Mental Health CentreUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchConsortium canadien en neurodégénérescence associée au vieillissementWeston Brain InstituteMcGill UniversityAlzheimer's Association
Mots-clésLocus coeruleusSegmentationVoxelIntraclass correlationArtificial intelligenceMagnetic resonance imagingPattern recognition (psychology)NeurosciencePsychologyComputer scienceMedicineCentral nervous systemRadiologyDevelopmental psychologyPsychometrics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Following the development of magnetic resonance imaging (MRI) methods to assay the integrity of catecholamine nuclei, including the locus coeruleus (LC), there has been an effort to develop automated methods that can accurately segment this small structure in an automated manner to promote its widespread use and overcome limitations of manual segmentation. Here we characterize an automated LC segmentation approach (referred to as the funnel-tip [FT] method) in healthy individuals and individuals with LC degeneration in the context of Alzheimer's disease (AD, confirmed with tau-PET imaging using [18F]MK6240). The first sample included n = 190 individuals across the AD spectrum from cognitively normal to moderate AD. LC signal assayed with FT segmentation showed excellent agreement with manual segmentation (intraclass correlation coefficient [ICC] = 0.91). Compared to other methods, the FT method showed numerically higher correlation to AD status (defined by presence of tau: Cohen's d = 0.64) and AD severity (Braak stage: Pearson R = -.35, cognitive function: R = .25). In a separate sample of n = 12 control participants, the FT method showed excellent scan-rescan reliability (ICC = 0.82). In another sample of n = 30 control participants, we found that the structure of the LC defined by FT segmentation approximated its expected shape as a contiguous line: <5% of LC voxels strayed >1 voxel (0.69 mm) from this line. The FT LC segmentation shows high agreement with manual segmentation and captures LC degeneration in AD. This practical method may facilitate larger research studies of the human LC-norepinephrine system and has potential to support future use of neuromelanin-sensitive MRI as a clinical biomarker.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,979
Score d'incertitude au seuil0,401

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,066
Tête enseignante GPT0,397
Écart entre enseignants0,331 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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