Detection of <i>Chlamydia abortus</i> in aborted chorioallantoises of horses from Western Canada
Notice bibliographique
Résumé
Chlamydiae are reported to cause abortion in several species, however the association between Chlamydia sp. and equine abortions is poorly understood. A zoonotic transfer event of C. psittaci from aborted equine tissues in Australia has emphasized the need to better understand the prevalence of this pathogen in equine populations. The prevalence of chlamydia in equine abortions in North America has not been investigated thoroughly. We examined 99 formalin-fixed, paraffin-embedded placental samples submitted between 2009 and 2020 from equine abortions in Western Canada using chlamydia-specific 16S rRNA conventional PCR testing; 26 of 99 submissions tested positive for chlamydial DNA. Most of these submissions ( n = 17) had no final diagnosis noted on their original pathology reports. DNA sequencing identified 22 of the 26 cases as C. abortus; 21 of the 22 C. abortus–positive samples were positive on chlamydial immunohistochemistry. These findings contrast with studies in Europe that found a low prevalence of chlamydiae using similar methodology. The high prevalence of the potentially zoonotic C. abortus identified in our study suggests that more substantial biosecurity protocols may be warranted for equine foaling, abortion, and stillbirth in Western Canada to prevent zoonotic transfer of the pathogen.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».