MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4367670327 · doi:10.1101/2023.05.02.539102

Autonomous development and regeneration of isolated rice egg cells in a fertilization-independent manner

2023· preprint· en· W4367670327 sur OpenAlexfundno aff
Kasidit Rattanawong, Kaori Totsuka, Shizuka Koshimizu, Kentaro Yano, Takashi Okamoto

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueChromosomal and Genetic Variations
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsRIKENTokyo Metropolitan UniversityJapan Society for the Promotion of ScienceMeiji University
Mots-clésEgg cellBiologyParthenogenesisPloidyPolyploidEmbryoGenomeBotanyHuman fertilizationGeneticsMitosisHybridSubspeciesGeneZoology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Parthenogenesis is suppressed in rice egg cells to avoid precocious development before fertilization. We found that cold treatment released cell cycle arrest in egg cells and triggered mitosis. Egg cells isolated from japonica (Nipponbare; NB) and aus (Kasalath; KS) subspecies divided and regenerated into mature plants after cold treatment. The egg-derived plants showed variety of ploidy levels, including haploid (n), diploid (2n), and tetraploid (4n). Nuclear DNA quantification showed that genome duplication occurred during early parthenogenetic development. Owing to the presence of single nucleotide polymorphisms (SNPs) between NB and KS, inter-subspecific hybrid plants (NB-KS hybrids) were created via electrofusion. Egg cells from the NB-KS hybrid developed parthenogenetically into polyploid plants. 2n and 4n plants originating from the same NB-KS egg cell displayed the same homozygous SNP patterns throughout the genome, indicating that these plants were doubled and quadrupled haploids. Transcriptome analyses of cold-treated egg cells demonstrated that parthenogenesis-related candidate genes, including OsBBML1 , were upregulated.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,201
Écart entre enseignants0,182 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)Même sujetChromosomal and Genetic VariationsTravaux en français237 207