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Enregistrement W4367672378 · doi:10.1139/cjss-2022-0121

Land use in the Prairie Pothole Region influences the soil bacterial community composition and relative abundance of nitrogen cycling genes

2023· article· en· W4367672378 sur OpenAlexafffundvenue
Jennifer R. Town, Min Yu, Reynald Lemke, Bobbi L. Helgason

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Soil Science · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial Community Ecology and Physiology
Établissements canadiensUniversity of SaskatchewanAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food Canada
Mots-clésAbundance (ecology)Environmental scienceSoil waterGrasslandNutrient cycleRelative species abundanceNutrientCyclingAgronomyEcologyMicrobial population biologyLand coverNitrogen cycleLand useNitrogenSoil scienceBiologyGeographyChemistryForestry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The undulating topography of Prairie Pothole Region of North America creates spatial and temporal variability in soil moisture and nutrient levels, affecting microbial community processes and greenhouse gas emissions. By identifying differences in soil bacterial and archaeal community composition and the abundance of nitrogen cycling genes in permanent cover versus annual crop land over two growing seasons (2017 and 2018), we were able to assess the effects of topography and land use on the functional capacity of the soil microbiome. Permanent grassland cover was associated with higher bacterial diversity in upland positions and lower diversity in low-lying depressions. Bacterial community composition was also significantly different between cultivated and permanent cover at all points along the topographic slope, with the largest effects seen in the footslope and backslope positions. Compared to permanent cover, soil from annual cropland had consistently more abundant nitrifiers, including Nitrospira in the toeslope and backslope, and Nitrososphaeraceae in the shoulder and knoll samples while soils from permanent cover had a greater abundance of several Alphaproteobacteria from Rhodospirillales and Hyphomicrobiaceae across multiple upland positions. Upland soils from annual cropland also had consistently higher abundance of both bacterial and archaeal ammonia oxidizing ( amoA) genes and a higher ratio of nirK: nirS genes compared to those from permanent cover. These differences in microbial community composition were associated with higher N2O and CO2 emissions in upland soils in annual cropland; however, there were no differences in GHG emissions between the two systems in low-lying positions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,977
Score d'incertitude au seuil0,045

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2023
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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