Rheological profiles of DNA extracts from forensic bloodstain samples
Notice bibliographique
Résumé
Rheology can be used to probe the differences in physical properties and in-solution behaviours of synthetic and biological polymers, like deoxyribonucleic acid (DNA). Large fragments of highly concentrated genomic and phage DNA have been characterized using rheology; however, this amount and size of DNA are atypical in DNA extracted from forensic evidence. To determine the applicability of rheology for the analysis of dilute concentrations of short DNA fragments expected from forensic specimens (low molecular weight DNA at concentrations in the ng/µL range), we conducted an optimization experiment in which we varied the size, concentration, and conformation of synthetic DNA in various solvents and polymer matrices. We found that incorporating DNA into an alginate-based, ionically crosslinked hydrogel produced the greatest differences in rheological profiles from synthetic DNA comprised of different physical properties. The conformation and size of encapsulated DNA provided significantly different responses during dynamic oscillatory measurements (p<0.05). Additionally, a time since deposition (TSD) study was performed using rotational and oscillatory tests to understand the changes in DNA extracts from bloodstains left to degrade for up to 19 months. DNA extracted from all timepoints could be detected and quantified for the tested temperature conditions (-20°C, 4°C, 22°C). Statistical analyses revealed moderate correlations between the rheological responses of DNA-containing materials and TSD (r = -0.57 to r = 0.62). Our results highlight the viability of rheology as a technique for the analysis of dilute DNA oligos and DNA extracts, and as a complementary technique for the determination of bloodstain TSD.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».