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Enregistrement W4367679508 · doi:10.26434/chemrxiv-2023-m33nt

Rheological profiles of DNA extracts from forensic bloodstain samples

2023· preprint· en· W4367679508 sur OpenAlexafffund
Colin Elliott, Theresa Stotesbury

Notice bibliographique

RevueChemRxiv · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBlood properties and coagulation
Établissements canadiensOntario Tech University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésRheologyDNAPolymergenomic DNAChemistryMaterials scienceMolecular biologyChromatographyBiochemistryBiologyOrganic chemistryComposite material

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Rheology can be used to probe the differences in physical properties and in-solution behaviours of synthetic and biological polymers, like deoxyribonucleic acid (DNA). Large fragments of highly concentrated genomic and phage DNA have been characterized using rheology; however, this amount and size of DNA are atypical in DNA extracted from forensic evidence. To determine the applicability of rheology for the analysis of dilute concentrations of short DNA fragments expected from forensic specimens (low molecular weight DNA at concentrations in the ng/µL range), we conducted an optimization experiment in which we varied the size, concentration, and conformation of synthetic DNA in various solvents and polymer matrices. We found that incorporating DNA into an alginate-based, ionically crosslinked hydrogel produced the greatest differences in rheological profiles from synthetic DNA comprised of different physical properties. The conformation and size of encapsulated DNA provided significantly different responses during dynamic oscillatory measurements (p<0.05). Additionally, a time since deposition (TSD) study was performed using rotational and oscillatory tests to understand the changes in DNA extracts from bloodstains left to degrade for up to 19 months. DNA extracted from all timepoints could be detected and quantified for the tested temperature conditions (-20°C, 4°C, 22°C). Statistical analyses revealed moderate correlations between the rheological responses of DNA-containing materials and TSD (r = -0.57 to r = 0.62). Our results highlight the viability of rheology as a technique for the analysis of dilute DNA oligos and DNA extracts, and as a complementary technique for the determination of bloodstain TSD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,085
Score d'incertitude au seuil0,776

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,095
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,194 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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