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Enregistrement W4368357436 · doi:10.1111/acel.13863

A DNA methylation based measure outperforms circulating CRP as a marker of chronic inflammation and partly reflects the monocytic response to long‐term inflammatory exposure: A Canadian Longitudinal Study on Aging analysis

2023· article· en· W4368357436 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevueAging Cell · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensMcMaster UniversityNOSM UniversityQueen's UniversityImpactHealth Sciences North
Organismes subventionnairesInstitute of AgingCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésInflammationEpigeneticsDNA methylationC-reactive proteinSystemic inflammationCohortBiologyImmunologyInternal medicineMedicineBioinformaticsOncologyPhysiologyGeneticsGeneGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A key hallmark in the age-related dysfunction of physiological systems is disruption related to the regulation of inflammation, often resulting in a chronic, low-grade inflammatory state (i.e., inflammaging). In order to understand the causes of overall system decline, methods to quantify the life-long exposure or damage related to chronic inflammation are critical. Here, we characterize a comprehensive epigenetic inflammation score (EIS) based on DNA methylation loci (CpGs) that are associated with circulating levels of C-reactive protein (CRP). In a cohort of 1446 older adults, we show that associations to age and health-related traits such as smoking history, chronic conditions, and established measures of accelerated aging were stronger for EIS than CRP, while the risk of longitudinal outcomes such as outpatient or inpatient visits and increased frailty were relatively similar. To determine whether variation in EIS actually reflects the cellular response to chronic inflammation we exposed THP1 myelo-monocytic cells to low levels of inflammatory mediators for 14 days, finding that EIS increased in response to both CRP (p = 0.011) and TNF (p = 0.068). Interestingly, a refined version of EIS based only on those CpGs that changed in vitro was more strongly associated with many of the aforementioned traits as compared to EIS. In conclusion, our study demonstrates that EIS outperforms circulating CRP with regard to its association to health-traits that are synonymous with chronic inflammation and accelerated aging, and substantiates its potential role as a clinically relevant tool for stratifying patient risk of adverse outcomes prior to treatment or following illness.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,368
Score d'incertitude au seuil0,805

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,303
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle