MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4368617378 · doi:10.1523/eneuro.0341-22.2023

Evaluation and Validation of Commercially Available Dopamine Transporter Antibodies

2023· article· en· W4368617378 sur OpenAlexafffund
Emma E. Russo, Lola E. Zovko, Reza Nazari, Hendrik W. Steenland, Amy J. Ramsey, Ali Salahpour

Notice bibliographique

RevueeNeuro · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeurotransmitter Receptor Influence on Behavior
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésDopamine transporterDopamineAntibodyTransporterComputational biologyNeuroscienceMedicineChemistryBiologyImmunologyDopaminergicBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

With a wide variety of dopamine transporter (DAT) antibodies available commercially, it is important to validate which antibodies provide sufficient immunodetection for reproducibility purpose and for accurate analysis of DAT levels and/or location. Commercially available DAT antibodies that are commonly used were tested in western blotting (WB) on wild-type (WT) and DAT-knock-out (DAT-KO) brain tissue and with immunohistology (IH) techniques against coronal slices of unilaterally lesioned 6-OHDA rats, in addition to wild-type and DAT-knock-out mice. DAT-KO mice and unilateral 6-OHDA lesions in rats were used as a negative control for DAT antibody specificity. Antibodies were tested at various concentrations and rated based on signal detection varying from no signal to optimal signal detection. Commonly used antibodies, including AB2231 and PT-22 524-1-AP, did not provide specific DAT signals in WB and IH. Although certain antibodies provided a good DAT signal, such as SC-32258, D6944, and MA5-24796, they also presented nonspecific bands in WB. Many DAT antibodies did not detect the DAT as advertised, and this characterization of DAT antibodies may provide a guide for immunodetection of DAT for molecular studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,042
Score d'incertitude au seuil0,449

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,087
Tête enseignante GPT0,329
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueeNeuroMême sujetNeurotransmitter Receptor Influence on BehaviorTravaux en français237 207