Differential analysis and genome-wide association analysis of stomata density of maize inbred lines leaves at ear position
Notice bibliographique
Résumé
The stomatal complex on the surface of maize leaves is closely related to photosynthesis and transpiration, and the study of maize stomatal phenotypes and the discovery of their regulatory genes are of great importance for the breeding of high-quality and high-yielding maize. In this study, rapid scanning electron microscopy was used to obtain images of the abaxial stomata of 457 maize inbred lines with extensive genetic variation, and stomata density was obtained by counting. The results of correlation showed that stomata density was significantly correlated with leaf width, and Analysis of variance found that there were significant differences ( P value < 0.05) in stomata density among different leaf width and 100-grain weight. The highest stomata density was found in the inbred lines with wide and short leaves and higher 100-grain weight. Furthermore, genome-wide association analysis was performed using a mixed linear model. It showed that eight SNPs significantly associated with stomata density were obtained, which could explain 35.507% of the phenotypic variation. Among these, four SNPs on chromosome 5 were tightly linked, mainly formatting two haplotypes, CTTA (0.636) and TCCG (0.330). Twelve genes with functional annotation were identified within 100 kb upstream and downstream of the eight SNPs. One gene, GRMZM2G068277, which had been shown to be involved in plant mitotic processes and exhibited high expression at the leaf base, was therefore the most likely candidate gene for stomata density. The results presented here could provide references for further cloning of functional genes related to stomata density.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».