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Enregistrement W4372334071 · doi:10.1186/s13062-023-00377-7

Probing pathways by which rhynchophylline modifies sleep using spatial transcriptomics

2023· article· en· W4372334071 sur OpenAlexafffund
Maria Neus Ballester Roig, Tanya Leduc, Julien Dufort‐Gervais, Yousra Maghmoul, Olivier Tastet, Valérie Mongrain

Notice bibliographique

RevueBiology Direct · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueSleep and Wakefulness Research
Établissements canadiensCentre Hospitalier de l’Université de MontréalCanadian Sleep & Circadian NetworkUniversité de MontréalCentre Intégré Universitaire de Santé et de Services Sociaux du Centre-Sud-de-l'Île-de-Montréal
Organismes subventionnairesUniversité de MontréalNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research ChairsGovernment of Canada
Mots-clésWakefulnessTranscriptomeBiologyNeuroscienceSleep (system call)ElectroencephalographyGene expressionGeneComputer scienceGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Rhynchophylline (RHY) is an alkaloid component of Uncaria, which are plants extensively used in traditional Asian medicines. Uncaria treatments increase sleep time and quality in humans, and RHY induces sleep in rats. However, like many traditional natural treatments, the mechanisms of action of RHY and Uncaria remain evasive. Moreover, it is unknown whether RHY modifies key brain oscillations during sleep. We thus aimed at defining the effects of RHY on sleep architecture and oscillations throughout a 24-h cycle, as well as identifying the underlying molecular mechanisms. Mice received systemic RHY injections at two times of the day (beginning and end of the light period), and vigilance states were studied by electrocorticographic recordings. RESULTS: RHY enhanced slow wave sleep (SWS) after both injections, suppressed paradoxical sleep (PS) in the light but enhanced PS in the dark period. Furthermore, RHY modified brain oscillations during both wakefulness and SWS (including delta activity dynamics) in a time-dependent manner. Interestingly, most effects were larger in females. A brain spatial transcriptomic analysis showed that RHY modifies the expression of genes linked to cell movement, apoptosis/necrosis, and transcription/translation in a brain region-independent manner, and changes those linked to sleep regulation (e.g., Hcrt, Pmch) in a brain region-specific manner (e.g., in the hypothalamus). CONCLUSIONS: The findings provide support to the sleep-inducing effect of RHY, expose the relevance to shape wake/sleep oscillations, and highlight its effects on the transcriptome with a high spatial resolution. The exposed molecular mechanisms underlying the effect of a natural compound should benefit sleep- and brain-related medicine.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,088
Tête enseignante GPT0,311
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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