Bacteria Isolated from Canada’s White Rabbit Cave Revealed Antimicrobial Activities
Notice bibliographique
Résumé
Caves offer a unique habitat for microorganisms, which allow the adaptation of exclusive metabolic pathways to the resources available. This environment could enable the production of primary and secondary metabolites with unique antimicrobial or enzymatic properties. White Rabbit Cave is located in the Monashee Mountain range in south-central British Columbia, a metamorphic range not known for cave and karst development. The present study has recovered bacterial isolates from the White Rabbit Cave and assessed them for their antimicrobial properties by employing the agar plug assay. One hundred and six bacterial isolates were cultivated from the collected samples, among which, five bacterial isolates displayed antimicrobial properties against a methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) strain. Furthermore, these five isolates were identified with 16S rRNA gene sequencing and through phylogenetic analysis. It has been observed that three of them (B076, B053, and B079) were identified as Streptomyces spp. (Phylum Actinobacteria) while the other two were recognized as Paenibacillus spp. (B039) and Paenibacillus terrae (B016) (Phylum Firmicutes). To the best of our knowledge, this is the first study that identifies bacterial species with antimicrobial properties from White Rabbit Cave in the Monashee Mountain range in British Columbia, Canada.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».