Comprehensive Metabolite Profiling of Two Edible <i>Garcinia</i> Species Based on UPLC-ESI-QTOF-MS<sup>E</sup> Coupled with Bioactivity Assays
Notice bibliographique
Résumé
In China, the endemic species Garcinia yunnanensis and native Garcinia xanthochymus are known as edible and medicinal plants. However, a systematic metabolomic and bioactivity evaluation of different plant parts from both species is lacking. In this study, comprehensive investigations of 11 plant parts of G. yunnanensis and 10 of G. xanthochymus employing UPLC-ESI-QTOF-MS E -based metabolomic analysis in conjunction with three bioactivity assays were undertaken. A customized chemotaxonomic-based in-house library containing 6456 compounds was constructed and coupled to the Progenesis QI informatic platform for metabolite annotations. From these two species, a total of 235 constituents were characterized using multiple criteria. Differences in metabolite profiles between the plant parts within each species were uncovered using multivariate analysis. Based on orthogonal partial least-squares discriminant analysis (OPLS-DA), 23 markers were identified as highly differential metabolites from G. xanthochymus and 20 from G. yunnanensis . Comparative assessment of the biological assays revealed the activity variations among different plant parts. The seeds of both species and G. yunnanensis latex exhibited excellent cytotoxic and antibacterial activities, while G. xanthochymus roots and G. yunnanensis arils showed strong anti-inflammatory effects. S -plot analysis identified 26 potential biomarkers for the observed activities, including the known cytotoxic agent cycloxanthochymol and the anti-inflammatory compound garcimultiflorone B, which likely explains some of the potent observed bioactivity.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».