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Enregistrement W4376108671 · doi:10.1139/gen-2023-0005

Genomics-based taxonomy to clarify cannabis classification

2023· review· en· W4376108671 sur OpenAlexafffundvenue
Éliana Lapierre, Adrian S. Monthony, Davoud Torkamaneh

Notice bibliographique

RevueGenome · 2023
Typereview
Langueen
DomaineNursing
ThématiqueBiochemical Analysis and Sensing Techniques
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity College Dublin
Mots-clésBiologyTaxonomy (biology)CannabisConfusionSubspeciesNomenclatureContext (archaeology)Evolutionary biologyGenomicsZoologyGenomeGeneticsGenePsychologyPaleontology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In the 18th century, Carolus Linnaeus created a formalized system of classification of living organisms based on their anatomic relationships, which we know as taxonomic nomenclature. Historically, the genus Cannabis has been described three ways under this system: Cannabis sativa by C. Linnaeus in 1753, Cannabis indica by J.B. Lamarck in 1785, and Cannabis ruderalis by D.E. Janischewsky in 1924, with these taxonomic classifications having been derived from physical, morphological, chemical, and geographical data. Today, this confusing taxonomy has led to an ongoing debate about whether the genus Cannabis consists of a single species or multiple distinct species or subspecies. Recently, genome sequencing and bioinformatics have provided greater resolution of taxonomic assignments at the species level. As a result, some previously discussed classification frameworks have been brought into question. The aim of this review is to provide a historical context for the confusion surrounding the taxonomy of the genus Cannabis and highlight recent research on genomics-based taxonomical approaches to clarify the question of Cannabis taxonomy. We suggest that the latest evidence shifts away from the previous multiple species framework and points towards the genus Cannabis consisting of a highly diverse monotypic species.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,979
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,159
Tête enseignante GPT0,348
Écart entre enseignants0,190 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations52
Publié2023
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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